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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.93659Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 295 / 3316537 465 / 2498449 5746 / 114162531 7482 / 109592465 295 / 3316537 465 / 2498449 5746 / 114162531 7482 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   7 / 57865 --   0 / 16077 7 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 4 / 14774 6 / 29891 463 / 5047110 83 / 4978364 4 / 14774 6 / 29891 463 / 5047110 83 / 4978364
brain 13 / 506301 23 / 200215 8 / 729526 220 / 4997811 13 / 506301 23 / 200215 8 / 729526 220 / 4997811
cartilage   5 / 37226 -- 35 / 778035 0 / 15965 5 / 37226 -- 35 / 778035
cerebellum     1 / 90885 43 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 43 / 1495938
cerebrum 8 / 198932 9 / 3422 -- -- 8 / 198932 9 / 3422 -- --
cervix   4 / 44577 -- -- 0 / 3888 4 / 44577 -- --
colon 5 / 26551 52 / 151167 1 / 98089 32 / 643586 5 / 26551 52 / 151167 1 / 98089 32 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 42 / 246043   -- -- 42 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine   1 / 2857 -- -- 0 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   6 / 17290 -- -- 0 / 270 6 / 17290 -- --
eye 14 / 128826 6 / 46440 6 / 85898 656 / 12434232 14 / 128826 6 / 46440 6 / 85898 656 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803 9 / 12721 1 / 45908 -- 3 / 28803 9 / 12721 1 / 45908 --
heart 5 / 76442   1 / 83063 -- 5 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 13 / 106627 14 / 89898 7 / 155372 11 / 100281 13 / 106627 14 / 89898 7 / 155372 11 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 20 / 107249 10 / 66308 7 / 214987 3 / 96846 20 / 107249 10 / 66308 7 / 214987
lung 20 / 128150 42 / 170663 18 / 159917 15 / 159059 20 / 128150 42 / 170663 18 / 159917 15 / 159059
lymph node 17 / 62650 4 / 27007 92 / 5278419 57 / 4863489 17 / 62650 4 / 27007 92 / 5278419 57 / 4863489
lymphoreticular   2 / 44303 -- -- 0 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 11 / 46553 27 / 104307 143 / 43166038 2263 / 30312656 11 / 46553 27 / 104307 143 / 43166038 2263 / 30312656
muscle 6 / 74039 3 / 27691 5 / 107836 3 / 61270 6 / 74039 3 / 27691 5 / 107836 3 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   23 / 89988 2 / 94887 15 / 179472 0 / 11462 23 / 89988 2 / 94887 15 / 179472
pancreas   15 / 74930 4 / 85728 13 / 189999 0 / 7237 15 / 74930 4 / 85728 13 / 189999
pancreatic islet 8 / 96524   -- -- 8 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 2 / 6170 -- -- -- 2 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 10 / 241088 6 / 39531 8 / 207348 -- 10 / 241088 6 / 39531 8 / 207348 --
pooled tissue 37 / 276455   -- -- 37 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 11 / 79993 25 / 107080 22 / 266949 21 / 491794 11 / 79993 25 / 107080 22 / 266949 21 / 491794
retina   -- 5 / 820326 4 / 88490 0 / 29438 -- 5 / 820326 4 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 18 / 73633 11 / 125377 966 / 26905847 1924 / 34522313 18 / 73633 11 / 125377 966 / 26905847 1924 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 1246 / 6230144 -- -- -- 1246 / 6230144 --
stomach   31 / 65644 7 / 124767 38 / 448716 0 / 26641 31 / 65644 7 / 124767 38 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 10 / 143630 7 / 100058 -- 2026 / 12372003 10 / 143630 7 / 100058 -- 2026 / 12372003
thymus 2 / 4478   -- -- 2 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 3 / 11737 8 / 32606 6 / 115938 11 / 124664 3 / 11737 8 / 32606 6 / 115938 11 / 124664
uncharacterized tissue 9 / 207932 69 / 479819 1 / 21833 5 / 51729 9 / 207932 69 / 479819 1 / 21833 5 / 51729
uterus 6 / 38063 25 / 133582 237 / 10193077 -- 6 / 38063 25 / 133582 237 / 10193077 --
vascular 6 / 46250 -- 2479 / 13135050 -- 6 / 46250 -- 2479 / 13135050 --
white blood cells -- -- 7 / 846268 -- -- -- 7 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --