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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.9235Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 174 / 3316537 198 / 2498449 2705 / 114162531 4659 / 109592465 174 / 3316537 198 / 2498449 2705 / 114162531 4659 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   6 / 57865 --   0 / 16077 6 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774   33 / 5047110 16 / 4978364 1 / 14774 0 / 29891 33 / 5047110 16 / 4978364
brain 9 / 506301 18 / 200215 16 / 729526 233 / 4997811 9 / 506301 18 / 200215 16 / 729526 233 / 4997811
cartilage   2 / 37226 -- 36 / 778035 0 / 15965 2 / 37226 -- 36 / 778035
cerebellum 2 / 90353   2 / 90885 78 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 2 / 90885 78 / 1495938
cerebrum 2 / 198932   -- -- 2 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 8 / 151167   19 / 643586 3 / 26551 8 / 151167 0 / 98089 19 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 18 / 246043   -- -- 18 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 3 / 19564 1 / 2857 -- -- 3 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 9 / 128826 5 / 46440 1 / 85898 342 / 12434232 9 / 128826 5 / 46440 1 / 85898 342 / 12434232
gastrointestinal tract   3 / 12721   -- 0 / 28803 3 / 12721 0 / 45908 --
heart 7 / 76442   5 / 83063 -- 7 / 76442 0 / 1 5 / 83063 --
kidney   5 / 89898 10 / 155372 7 / 100281 0 / 106627 5 / 89898 10 / 155372 7 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 4 / 96846 6 / 107249 2 / 66308 2 / 214987 4 / 96846 6 / 107249 2 / 66308 2 / 214987
lung 5 / 128150 16 / 170663 6 / 159917 12 / 159059 5 / 128150 16 / 170663 6 / 159917 12 / 159059
lymph node 2 / 62650   82 / 5278419 73 / 4863489 2 / 62650 0 / 27007 82 / 5278419 73 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553 24 / 104307 247 / 43166038 1215 / 30312656 3 / 46553 24 / 104307 247 / 43166038 1215 / 30312656
muscle 2 / 74039 1 / 27691 1 / 107836 1 / 61270 2 / 74039 1 / 27691 1 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 10 / 89988 12 / 94887 16 / 179472 1 / 11462 10 / 89988 12 / 94887 16 / 179472
pancreas   5 / 74930 2 / 85728 11 / 189999 0 / 7237 5 / 74930 2 / 85728 11 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524 3 / 30072 -- -- 4 / 96524 3 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 6 / 241088   7 / 207348 -- 6 / 241088 0 / 39531 7 / 207348 --
pooled tissue 24 / 276455   -- -- 24 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 43 / 79993 24 / 107080 22 / 266949 17 / 491794 43 / 79993 24 / 107080 22 / 266949 17 / 491794
retina   -- 9 / 820326   0 / 29438 -- 9 / 820326 0 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 6 / 73633 14 / 125377 286 / 26905847 1106 / 34522313 6 / 73633 14 / 125377 286 / 26905847 1106 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 461 / 6230144 -- -- -- 461 / 6230144 --
stomach 3 / 26641 3 / 65644 2 / 124767 6 / 448716 3 / 26641 3 / 65644 2 / 124767 6 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 3 / 143630   -- 1464 / 12372003 3 / 143630 0 / 100058 -- 1464 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 5 / 115938   0 / 11737 1 / 32606 5 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 7 / 207932 27 / 479819   5 / 51729 7 / 207932 27 / 479819 0 / 21833 5 / 51729
uterus 2 / 38063 12 / 133582 590 / 10193077 -- 2 / 38063 12 / 133582 590 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 899 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 899 / 13135050 --
white blood cells -- -- 5 / 846268 -- -- -- 5 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --