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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.89655Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 330 / 3316537 97 / 2498449 302 / 114162531 1125 / 109592465 330 / 3316537 97 / 2498449 302 / 114162531 1125 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow         0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 151 / 506301 35 / 200215 98 / 729526 101 / 4997811 151 / 506301 35 / 200215 98 / 729526 101 / 4997811
cartilage     -- 4 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 4 / 778035
cerebellum 61 / 90353   11 / 90885 41 / 1495938 61 / 90353 0 / 0 11 / 90885 41 / 1495938
cerebrum 87 / 198932 1 / 3422 -- -- 87 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon         0 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 2 / 246043   -- -- 2 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 5 / 128826 3 / 46440 1 / 85898 871 / 12434232 5 / 128826 3 / 46440 1 / 85898 871 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney   2 / 89898     0 / 106627 2 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver         0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung   16 / 170663     0 / 128150 16 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node     1 / 5278419   0 / 62650 0 / 27007 1 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   2 / 104307 65 / 43166038 34 / 30312656 0 / 46553 2 / 104307 65 / 43166038 34 / 30312656
muscle 1 / 74039 1 / 27691     1 / 74039 1 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary         0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas   1 / 74930   1 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet 15 / 96524 17 / 30072 -- -- 15 / 96524 17 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 3 / 6170 -- -- -- 3 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260 1 / 1358 -- -- 1 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta       -- 0 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 1 / 276455   -- -- 1 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993       1 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 0 / 491794
retina   -- 90 / 820326 10 / 88490 0 / 29438 -- 90 / 820326 10 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin       14 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 0 / 26905847 14 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 26 / 6230144 -- -- -- 26 / 6230144 --
stomach   1 / 65644   1 / 448716 0 / 26641 1 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis   3 / 100058 -- 48 / 12372003 0 / 143630 3 / 100058 -- 48 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue   14 / 479819     0 / 207932 14 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus       -- 0 / 38063 0 / 133582 0 / 10193077 --
vascular   -- 9 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 9 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1 / 846268 -- -- -- 1 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --