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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.88556Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 294 / 3316537 804 / 2498449 3719 / 114162531 5763 / 109592465 294 / 3316537 804 / 2498449 3719 / 114162531 5763 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 13 / 57865 -- 13 / 83577 2 / 16077 13 / 57865 -- 13 / 83577
bone marrow 1 / 14774 2 / 29891 2 / 5047110   1 / 14774 2 / 29891 2 / 5047110 0 / 4978364
brain 21 / 506301 18 / 200215 33 / 729526 702 / 4997811 21 / 506301 18 / 200215 33 / 729526 702 / 4997811
cartilage 1 / 15965 7 / 37226 -- 93 / 778035 1 / 15965 7 / 37226 -- 93 / 778035
cerebellum     1 / 90885 56 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 56 / 1495938
cerebrum 5 / 198932   -- -- 5 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   4 / 44577 -- -- 0 / 3888 4 / 44577 -- --
colon 4 / 26551 56 / 151167     4 / 26551 56 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 49 / 246043   -- -- 49 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 16 / 128826 2 / 46440 4 / 85898 1039 / 12434232 16 / 128826 2 / 46440 4 / 85898 1039 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 4 / 12721 1 / 45908 -- 1 / 28803 4 / 12721 1 / 45908 --
heart 7 / 76442   19 / 83063 -- 7 / 76442 0 / 1 19 / 83063 --
kidney 9 / 106627 18 / 89898 9 / 155372 1 / 100281 9 / 106627 18 / 89898 9 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 6 / 96846 9 / 107249 119 / 66308 2 / 214987 6 / 96846 9 / 107249 119 / 66308 2 / 214987
lung 15 / 128150 25 / 170663 81 / 159917 15 / 159059 15 / 128150 25 / 170663 81 / 159917 15 / 159059
lymph node 14 / 62650 3 / 27007 124 / 5278419 59 / 4863489 14 / 62650 3 / 27007 124 / 5278419 59 / 4863489
lymphoreticular 10 / 17836 26 / 44303 -- -- 10 / 17836 26 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 103 / 104307 1625 / 43166038 2031 / 30312656 2 / 46553 103 / 104307 1625 / 43166038 2031 / 30312656
muscle 2 / 74039 2 / 27691 11 / 107836 5 / 61270 2 / 74039 2 / 27691 11 / 107836 5 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 4 / 11462 15 / 89988 1 / 94887 22 / 179472 4 / 11462 15 / 89988 1 / 94887 22 / 179472
pancreas   23 / 74930 2 / 85728 18 / 189999 0 / 7237 23 / 74930 2 / 85728 18 / 189999
pancreatic islet 7 / 96524   -- -- 7 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 17 / 241088 4 / 39531 6 / 207348 -- 17 / 241088 4 / 39531 6 / 207348 --
pooled tissue 27 / 276455   -- -- 27 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 7 / 79993 11 / 107080 55 / 266949 16 / 491794 7 / 79993 11 / 107080 55 / 266949 16 / 491794
retina 3 / 29438 -- 40 / 820326 3 / 88490 3 / 29438 -- 40 / 820326 3 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 5 / 73633 14 / 125377 634 / 26905847 1610 / 34522313 5 / 73633 14 / 125377 634 / 26905847 1610 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 3 / 6230144 -- -- -- 3 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 209 / 65644 9 / 124767 41 / 448716 1 / 26641 209 / 65644 9 / 124767 41 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 6 / 143630 9 / 100058 -- 20 / 12372003 6 / 143630 9 / 100058 -- 20 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 8 / 32606 13 / 115938 15 / 124664 2 / 11737 8 / 32606 13 / 115938 15 / 124664
uncharacterized tissue 39 / 207932 179 / 479819 1 / 21833 2 / 51729 39 / 207932 179 / 479819 1 / 21833 2 / 51729
uterus 2 / 38063 34 / 133582 870 / 10193077 -- 2 / 38063 34 / 133582 870 / 10193077 --
vascular 4 / 46250 -- 51 / 13135050 -- 4 / 46250 -- 51 / 13135050 --
white blood cells -- -- 5 / 846268 -- -- -- 5 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --