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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.86905Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 324 / 3316537 172 / 2498449 2068 / 114162531 4162 / 109592465 324 / 3316537 172 / 2498449 2068 / 114162531 4162 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 --   0 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   6 / 29891 30 / 5047110 22 / 4978364 0 / 14774 6 / 29891 30 / 5047110 22 / 4978364
brain 78 / 506301 7 / 200215 12 / 729526 110 / 4997811 78 / 506301 7 / 200215 12 / 729526 110 / 4997811
cartilage 1 / 15965 2 / 37226 -- 10 / 778035 1 / 15965 2 / 37226 -- 10 / 778035
cerebellum 12 / 90353   1 / 90885 23 / 1495938 12 / 90353 0 / 0 1 / 90885 23 / 1495938
cerebrum 48 / 198932   -- -- 48 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   3 / 44577 -- -- 0 / 3888 3 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 2 / 151167   5 / 643586 1 / 26551 2 / 151167 0 / 98089 5 / 643586
ear 3 / 16130 -- -- -- 3 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 11 / 246043   -- -- 11 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 3 / 19564   -- -- 3 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   4 / 17290 -- -- 0 / 270 4 / 17290 -- --
eye 10 / 128826 3 / 46440 1 / 85898 677 / 12434232 10 / 128826 3 / 46440 1 / 85898 677 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 2 / 12721   -- 1 / 28803 2 / 12721 0 / 45908 --
heart 7 / 76442     -- 7 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 19 / 106627 4 / 89898 1 / 155372 2 / 100281 19 / 106627 4 / 89898 1 / 155372 2 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 8 / 107249 1 / 66308 5 / 214987 2 / 96846 8 / 107249 1 / 66308 5 / 214987
lung 5 / 128150 8 / 170663 4 / 159917 2 / 159059 5 / 128150 8 / 170663 4 / 159917 2 / 159059
lymph node 9 / 62650 6 / 27007 211 / 5278419 118 / 4863489 9 / 62650 6 / 27007 211 / 5278419 118 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland   10 / 104307 110 / 43166038 1320 / 30312656 0 / 46553 10 / 104307 110 / 43166038 1320 / 30312656
muscle 3 / 74039   2 / 107836   3 / 74039 0 / 27691 2 / 107836 0 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 3 / 89988   6 / 179472 2 / 11462 3 / 89988 0 / 94887 6 / 179472
pancreas   3 / 74930 1 / 85728 2 / 189999 0 / 7237 3 / 74930 1 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet 6 / 96524 2 / 30072 -- -- 6 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 21 / 241088 2 / 39531 2 / 207348 -- 21 / 241088 2 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 15 / 276455   -- -- 15 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 4 / 79993 9 / 107080 5 / 266949 8 / 491794 4 / 79993 9 / 107080 5 / 266949 8 / 491794
retina   -- 15 / 820326 2 / 88490 0 / 29438 -- 15 / 820326 2 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin 9 / 73633 11 / 125377 714 / 26905847 1264 / 34522313 9 / 73633 11 / 125377 714 / 26905847 1264 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 6 / 52939   -- -- 6 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 206 / 6230144 -- -- -- 206 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 21 / 65644 3 / 124767 11 / 448716 1 / 26641 21 / 65644 3 / 124767 11 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 8 / 143630 7 / 100058 -- 569 / 12372003 8 / 143630 7 / 100058 -- 569 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606 6 / 115938 5 / 124664 0 / 11737 2 / 32606 6 / 115938 5 / 124664
uncharacterized tissue 19 / 207932 30 / 479819   1 / 51729 19 / 207932 30 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 8 / 38063 10 / 133582 208 / 10193077 -- 8 / 38063 10 / 133582 208 / 10193077 --
vascular 4 / 46250 -- 509 / 13135050 -- 4 / 46250 -- 509 / 13135050 --
white blood cells -- -- 26 / 846268 -- -- -- 26 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --