Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.79347Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 137 / 3316537 103 / 2498449 1796 / 114162531 3179 / 109592465 137 / 3316537 103 / 2498449 1796 / 114162531 3179 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   2 / 29891 107 / 5047110 130 / 4978364 0 / 14774 2 / 29891 107 / 5047110 130 / 4978364
brain 24 / 506301 10 / 200215 22 / 729526 319 / 4997811 24 / 506301 10 / 200215 22 / 729526 319 / 4997811
cartilage     -- 61 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 61 / 778035
cerebellum 2 / 90353     29 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 0 / 90885 29 / 1495938
cerebrum 10 / 198932   -- -- 10 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 5 / 151167   4 / 643586 1 / 26551 5 / 151167 0 / 98089 4 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 15 / 246043   -- -- 15 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 4 / 128826 1 / 46440   132 / 12434232 4 / 128826 1 / 46440 0 / 85898 132 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803   1 / 45908 -- 1 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart 3 / 76442   2 / 83063 -- 3 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 5 / 106627 1 / 89898 2 / 155372 2 / 100281 5 / 106627 1 / 89898 2 / 155372 2 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 1 / 107249 3 / 66308 3 / 214987 2 / 96846 1 / 107249 3 / 66308 3 / 214987
lung 6 / 128150 4 / 170663 28 / 159917 6 / 159059 6 / 128150 4 / 170663 28 / 159917 6 / 159059
lymph node 9 / 62650 5 / 27007 144 / 5278419 96 / 4863489 9 / 62650 5 / 27007 144 / 5278419 96 / 4863489
lymphoreticular 3 / 17836 1 / 44303 -- -- 3 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 6 / 104307 183 / 43166038 1412 / 30312656 1 / 46553 6 / 104307 183 / 43166038 1412 / 30312656
muscle 5 / 74039   1 / 107836 1 / 61270 5 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 1 / 61270
nervous 3 / 10333   -- -- 3 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   3 / 89988 3 / 94887 4 / 179472 0 / 11462 3 / 89988 3 / 94887 4 / 179472
pancreas 1 / 7237 6 / 74930   8 / 189999 1 / 7237 6 / 74930 0 / 85728 8 / 189999
pancreatic islet 3 / 96524 4 / 30072 -- -- 3 / 96524 4 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 5 / 241088   10 / 207348 -- 5 / 241088 0 / 39531 10 / 207348 --
pooled tissue 6 / 276455   -- -- 6 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 2 / 107080 2 / 266949 8 / 491794 2 / 79993 2 / 107080 2 / 266949 8 / 491794
retina 3 / 29438 -- 8 / 820326   3 / 29438 -- 8 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 1 / 73633 4 / 125377 603 / 26905847 755 / 34522313 1 / 73633 4 / 125377 603 / 26905847 755 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 158 / 6230144 -- -- -- 158 / 6230144 --
stomach   4 / 65644   12 / 448716 0 / 26641 4 / 65644 0 / 124767 12 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 5 / 143630 4 / 100058 -- 195 / 12372003 5 / 143630 4 / 100058 -- 195 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 4 / 11737   1 / 115938 1 / 124664 4 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 8 / 207932 28 / 479819 1 / 21833 1 / 51729 8 / 207932 28 / 479819 1 / 21833 1 / 51729
uterus 1 / 38063 10 / 133582 190 / 10193077 -- 1 / 38063 10 / 133582 190 / 10193077 --
vascular   -- 280 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 280 / 13135050 --
white blood cells -- -- 47 / 846268 -- -- -- 47 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --