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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.789Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 59 / 3316537 77 / 2498449 3359 / 114162531 8598 / 109592465 59 / 3316537 77 / 2498449 3359 / 114162531 8598 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     125 / 5047110 51 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 125 / 5047110 51 / 4978364
brain 2 / 506301   7 / 729526 41 / 4997811 2 / 506301 0 / 200215 7 / 729526 41 / 4997811
cartilage   13 / 37226 -- 189 / 778035 0 / 15965 13 / 37226 -- 189 / 778035
cerebellum       11 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 11 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888   -- -- 1 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 8 / 151167   23 / 643586 2 / 26551 8 / 151167 0 / 98089 23 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 2 / 128826     4 / 12434232 2 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 4 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 1 / 76442     -- 1 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney   2 / 89898     0 / 106627 2 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   15 / 107249   2 / 214987 0 / 96846 15 / 107249 0 / 66308 2 / 214987
lung 5 / 128150 11 / 170663 4 / 159917 4 / 159059 5 / 128150 11 / 170663 4 / 159917 4 / 159059
lymph node 3 / 62650   22 / 5278419   3 / 62650 0 / 27007 22 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553   2508 / 43166038 7287 / 30312656 1 / 46553 0 / 104307 2508 / 43166038 7287 / 30312656
muscle       1 / 61270 0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   2 / 89988 64 / 94887 2 / 179472 0 / 11462 2 / 89988 64 / 94887 2 / 179472
pancreas   1 / 74930   4 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 4 / 189999
pancreatic islet 6 / 96524   -- -- 6 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 2 / 241088     -- 2 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 5 / 276455   -- -- 5 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993   2 / 266949 9 / 491794 2 / 79993 0 / 107080 2 / 266949 9 / 491794
retina   -- 1 / 820326   0 / 29438 -- 1 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 7 / 73633 6 / 125377 21 / 26905847 942 / 34522313 7 / 73633 6 / 125377 21 / 26905847 942 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 7 / 6230144 -- -- -- 7 / 6230144 --
stomach 5 / 26641 4 / 65644 4 / 124767 17 / 448716 5 / 26641 4 / 65644 4 / 124767 17 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 9 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 9 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606 1 / 115938   0 / 11737 2 / 32606 1 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 6 / 207932 7 / 479819 1 / 21833 2 / 51729 6 / 207932 7 / 479819 1 / 21833 2 / 51729
uterus 2 / 38063 5 / 133582 9 / 10193077 -- 2 / 38063 5 / 133582 9 / 10193077 --
vascular 6 / 46250 -- 522 / 13135050 -- 6 / 46250 -- 522 / 13135050 --
white blood cells -- -- 61 / 846268 -- -- -- 61 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --