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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.78601Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 376 / 3316537 396 / 2498449 2425 / 114162531 3632 / 109592465 376 / 3316537 396 / 2498449 2425 / 114162531 3632 / 109592465
adrenal cortex -- 3 / 9928 -- -- -- 3 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   5 / 57865 -- 7 / 83577 0 / 16077 5 / 57865 -- 7 / 83577
bone marrow 5 / 14774 4 / 29891 274 / 5047110 195 / 4978364 5 / 14774 4 / 29891 274 / 5047110 195 / 4978364
brain 37 / 506301 46 / 200215 55 / 729526 554 / 4997811 37 / 506301 46 / 200215 55 / 729526 554 / 4997811
cartilage   9 / 37226 -- 120 / 778035 0 / 15965 9 / 37226 -- 120 / 778035
cerebellum 12 / 90353   4 / 90885 114 / 1495938 12 / 90353 0 / 0 4 / 90885 114 / 1495938
cerebrum 8 / 198932   -- -- 8 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   4 / 44577 -- -- 0 / 3888 4 / 44577 -- --
colon   20 / 151167 2 / 98089 50 / 643586 0 / 26551 20 / 151167 2 / 98089 50 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 33 / 246043   -- -- 33 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564 1 / 2857 -- -- 2 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 14 / 128826 7 / 46440 2 / 85898 207 / 12434232 14 / 128826 7 / 46440 2 / 85898 207 / 12434232
gastrointestinal tract   2 / 12721   -- 0 / 28803 2 / 12721 0 / 45908 --
heart 19 / 76442   5 / 83063 -- 19 / 76442 0 / 1 5 / 83063 --
kidney 29 / 106627 22 / 89898 13 / 155372 9 / 100281 29 / 106627 22 / 89898 13 / 155372 9 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 10 / 96846 24 / 107249 7 / 66308 11 / 214987 10 / 96846 24 / 107249 7 / 66308 11 / 214987
lung 15 / 128150 34 / 170663 13 / 159917 17 / 159059 15 / 128150 34 / 170663 13 / 159917 17 / 159059
lymph node 4 / 62650   230 / 5278419 35 / 4863489 4 / 62650 0 / 27007 230 / 5278419 35 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 7 / 44303 -- -- 1 / 17836 7 / 44303 -- --
mammary gland   4 / 104307 377 / 43166038 805 / 30312656 0 / 46553 4 / 104307 377 / 43166038 805 / 30312656
muscle 4 / 74039 9 / 27691 7 / 107836 3 / 61270 4 / 74039 9 / 27691 7 / 107836 3 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   12 / 89988 12 / 94887 16 / 179472 0 / 11462 12 / 89988 12 / 94887 16 / 179472
pancreas   5 / 74930 9 / 85728 5 / 189999 0 / 7237 5 / 74930 9 / 85728 5 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524   -- -- 4 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   17 / 20557 -- -- 0 / 24 17 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260 1 / 1358 -- -- 3 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 26 / 241088 7 / 39531 16 / 207348 -- 26 / 241088 7 / 39531 16 / 207348 --
pooled tissue 48 / 276455   -- -- 48 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 19 / 79993 29 / 107080 14 / 266949 28 / 491794 19 / 79993 29 / 107080 14 / 266949 28 / 491794
retina 2 / 29438 -- 65 / 820326 3 / 88490 2 / 29438 -- 65 / 820326 3 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 7 / 73633 32 / 125377 276 / 26905847 651 / 34522313 7 / 73633 32 / 125377 276 / 26905847 651 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 6 / 52939   -- -- 6 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 172 / 6230144 -- -- -- 172 / 6230144 --
stomach   3 / 65644 11 / 124767 23 / 448716 0 / 26641 3 / 65644 11 / 124767 23 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 8 / 143630 13 / 100058 -- 768 / 12372003 8 / 143630 13 / 100058 -- 768 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 21 / 32606 8 / 115938 6 / 124664 1 / 11737 21 / 32606 8 / 115938 6 / 124664
uncharacterized tissue 40 / 207932 38 / 479819 6 / 21833 5 / 51729 40 / 207932 38 / 479819 6 / 21833 5 / 51729
uterus 13 / 38063 12 / 133582 444 / 10193077 -- 13 / 38063 12 / 133582 444 / 10193077 --
vascular 3 / 46250 -- 376 / 13135050 -- 3 / 46250 -- 376 / 13135050 --
white blood cells -- -- 27 / 846268 -- -- -- 27 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --