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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.77498Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 239 / 3316537 180 / 2498449 1773 / 114162531 2136 / 109592465 239 / 3316537 180 / 2498449 1773 / 114162531 2136 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   1 / 29891 6 / 5047110 4 / 4978364 0 / 14774 1 / 29891 6 / 5047110 4 / 4978364
brain 40 / 506301 22 / 200215 17 / 729526 110 / 4997811 40 / 506301 22 / 200215 17 / 729526 110 / 4997811
cartilage   6 / 37226 -- 12 / 778035 0 / 15965 6 / 37226 -- 12 / 778035
cerebellum 4 / 90353   1 / 90885 52 / 1495938 4 / 90353 0 / 0 1 / 90885 52 / 1495938
cerebrum 8 / 198932   -- -- 8 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 10 / 151167   11 / 643586 1 / 26551 10 / 151167 0 / 98089 11 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 10 / 246043   -- -- 10 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 11 / 128826 10 / 46440 1 / 85898 510 / 12434232 11 / 128826 10 / 46440 1 / 85898 510 / 12434232
gastrointestinal tract 4 / 28803     -- 4 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 2 / 76442   3 / 83063 -- 2 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 1 / 106627 5 / 89898 8 / 155372 3 / 100281 1 / 106627 5 / 89898 8 / 155372 3 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 8 / 96846 15 / 107249 2 / 66308 7 / 214987 8 / 96846 15 / 107249 2 / 66308 7 / 214987
lung 14 / 128150 10 / 170663 4 / 159917 2 / 159059 14 / 128150 10 / 170663 4 / 159917 2 / 159059
lymph node 3 / 62650   106 / 5278419 26 / 4863489 3 / 62650 0 / 27007 106 / 5278419 26 / 4863489
lymphoreticular   2 / 44303 -- -- 0 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 6 / 46553 9 / 104307 374 / 43166038 755 / 30312656 6 / 46553 9 / 104307 374 / 43166038 755 / 30312656
muscle 1 / 74039 1 / 27691     1 / 74039 1 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 3 / 11462 8 / 89988 3 / 94887 4 / 179472 3 / 11462 8 / 89988 3 / 94887 4 / 179472
pancreas   2 / 74930 2 / 85728   0 / 7237 2 / 74930 2 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 11 / 96524 2 / 30072 -- -- 11 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid   4 / 20557 -- -- 0 / 24 4 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 8 / 241088 2 / 39531 6 / 207348 -- 8 / 241088 2 / 39531 6 / 207348 --
pooled tissue 37 / 276455   -- -- 37 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 8 / 79993 4 / 107080 12 / 266949 11 / 491794 8 / 79993 4 / 107080 12 / 266949 11 / 491794
retina 2 / 29438 -- 26 / 820326 3 / 88490 2 / 29438 -- 26 / 820326 3 / 88490
salivary gland 1 / 2490   -- -- 1 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 4 / 73633 19 / 125377 470 / 26905847 429 / 34522313 4 / 73633 19 / 125377 470 / 26905847 429 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 125 / 6230144 -- -- -- 125 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 2 / 65644 1 / 124767 18 / 448716 2 / 26641 2 / 65644 1 / 124767 18 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 29 / 143630 6 / 100058 -- 168 / 12372003 29 / 143630 6 / 100058 -- 168 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   3 / 32606 6 / 115938 9 / 124664 0 / 11737 3 / 32606 6 / 115938 9 / 124664
uncharacterized tissue 13 / 207932 23 / 479819   2 / 51729 13 / 207932 23 / 479819 0 / 21833 2 / 51729
uterus 2 / 38063 9 / 133582 206 / 10193077 -- 2 / 38063 9 / 133582 206 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 375 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 375 / 13135050 --
white blood cells -- -- 19 / 846268 -- -- -- 19 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --