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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.743562Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 36 / 3316537 44 / 2498449 1687 / 114162531 1369 / 109592465 36 / 3316537 44 / 2498449 1687 / 114162531 1369 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     11 / 5047110 9 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 11 / 5047110 9 / 4978364
brain 4 / 506301 4 / 200215 25 / 729526 103 / 4997811 4 / 506301 4 / 200215 25 / 729526 103 / 4997811
cartilage     -- 9 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 9 / 778035
cerebellum     1 / 90885 22 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 22 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon   4 / 151167 3 / 98089 18 / 643586 0 / 26551 4 / 151167 3 / 98089 18 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 1 / 246043   -- -- 1 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 5 / 128826   2 / 85898 497 / 12434232 5 / 128826 0 / 46440 2 / 85898 497 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 1 / 76442   1 / 83063 -- 1 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 1 / 106627 2 / 89898 2 / 155372 5 / 100281 1 / 106627 2 / 89898 2 / 155372 5 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   1 / 107249 1 / 66308   0 / 96846 1 / 107249 1 / 66308 0 / 214987
lung 2 / 128150 7 / 170663 3 / 159917 1 / 159059 2 / 128150 7 / 170663 3 / 159917 1 / 159059
lymph node 1 / 62650   17 / 5278419 22 / 4863489 1 / 62650 0 / 27007 17 / 5278419 22 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836   -- -- 1 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   3 / 104307 960 / 43166038 348 / 30312656 0 / 46553 3 / 104307 960 / 43166038 348 / 30312656
muscle 2 / 74039 1 / 27691 9 / 107836   2 / 74039 1 / 27691 9 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 1 / 89988   6 / 179472 1 / 11462 1 / 89988 0 / 94887 6 / 179472
pancreas   2 / 74930 3 / 85728 7 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 3 / 85728 7 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 4 / 241088     -- 4 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 2 / 276455   -- -- 2 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 6 / 79993 3 / 107080 8 / 266949 18 / 491794 6 / 79993 3 / 107080 8 / 266949 18 / 491794
retina 2 / 29438 -- 8 / 820326 2 / 88490 2 / 29438 -- 8 / 820326 2 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin   1 / 125377 221 / 26905847 160 / 34522313 0 / 73633 1 / 125377 221 / 26905847 160 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 80 / 6230144 -- -- -- 80 / 6230144 --
stomach   4 / 65644   4 / 448716 0 / 26641 4 / 65644 0 / 124767 4 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630   -- 138 / 12372003 2 / 143630 0 / 100058 -- 138 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 1 / 207932 6 / 479819     1 / 207932 6 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   2 / 133582 103 / 10193077 -- 0 / 38063 2 / 133582 103 / 10193077 --
vascular   -- 221 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 221 / 13135050 --
white blood cells -- -- 8 / 846268 -- -- -- 8 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --