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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.743361Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 342 / 3316537 123 / 2498449 2153 / 114162531 2121 / 109592465 342 / 3316537 123 / 2498449 2153 / 114162531 2121 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077   --   2 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774 1 / 29891 6 / 5047110 12 / 4978364 1 / 14774 1 / 29891 6 / 5047110 12 / 4978364
brain 71 / 506301 8 / 200215 23 / 729526 155 / 4997811 71 / 506301 8 / 200215 23 / 729526 155 / 4997811
cartilage 7 / 15965 2 / 37226 -- 10 / 778035 7 / 15965 2 / 37226 -- 10 / 778035
cerebellum 18 / 90353   3 / 90885 44 / 1495938 18 / 90353 0 / 0 3 / 90885 44 / 1495938
cerebrum 46 / 198932   -- -- 46 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   3 / 44577 -- -- 0 / 3888 3 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 8 / 151167   7 / 643586 1 / 26551 8 / 151167 0 / 98089 7 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 8 / 246043   -- -- 8 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 5 / 19564   -- -- 5 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 13 / 128826 1 / 46440   184 / 12434232 13 / 128826 1 / 46440 0 / 85898 184 / 12434232
gastrointestinal tract 5 / 28803 2 / 12721   -- 5 / 28803 2 / 12721 0 / 45908 --
heart 9 / 76442   11 / 83063 -- 9 / 76442 0 / 1 11 / 83063 --
kidney 19 / 106627 8 / 89898 3 / 155372   19 / 106627 8 / 89898 3 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 6 / 96846 3 / 107249 2 / 66308 1 / 214987 6 / 96846 3 / 107249 2 / 66308 1 / 214987
lung 8 / 128150 5 / 170663 2 / 159917 1 / 159059 8 / 128150 5 / 170663 2 / 159917 1 / 159059
lymph node 5 / 62650 2 / 27007 42 / 5278419 110 / 4863489 5 / 62650 2 / 27007 42 / 5278419 110 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 4 / 46553 2 / 104307 428 / 43166038 503 / 30312656 4 / 46553 2 / 104307 428 / 43166038 503 / 30312656
muscle 9 / 74039   5 / 107836   9 / 74039 0 / 27691 5 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     1 / 94887 8 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 1 / 94887 8 / 179472
pancreas   1 / 74930 1 / 85728 3 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 1 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 20 / 96524   -- -- 20 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 15 / 241088   3 / 207348 -- 15 / 241088 0 / 39531 3 / 207348 --
pooled tissue 13 / 276455   -- -- 13 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 5 / 79993 7 / 107080 7 / 266949 13 / 491794 5 / 79993 7 / 107080 7 / 266949 13 / 491794
retina 7 / 29438 -- 36 / 820326 1 / 88490 7 / 29438 -- 36 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 4 / 73633 3 / 125377 606 / 26905847 591 / 34522313 4 / 73633 3 / 125377 606 / 26905847 591 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 4 / 52939   -- -- 4 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 482 / 6230144 -- -- -- 482 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 13 / 65644 5 / 124767 13 / 448716 1 / 26641 13 / 65644 5 / 124767 13 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 12 / 143630 11 / 100058 -- 451 / 12372003 12 / 143630 11 / 100058 -- 451 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 4 / 115938 13 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 4 / 115938 13 / 124664
uncharacterized tissue 9 / 207932 29 / 479819   1 / 51729 9 / 207932 29 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 8 / 38063 8 / 133582 200 / 10193077 -- 8 / 38063 8 / 133582 200 / 10193077 --
vascular 4 / 46250 -- 273 / 13135050 -- 4 / 46250 -- 273 / 13135050 --
white blood cells -- -- 10 / 846268 -- -- -- 10 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --