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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.743286Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 675 / 3316537 985 / 2498449 210815 / 114162531 104923 / 109592465 675 / 3316537 985 / 2498449 210815 / 114162531 104923 / 109592465
adrenal cortex -- 3 / 9928 -- -- -- 3 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 6 / 16077 28 / 57865 -- 5 / 83577 6 / 16077 28 / 57865 -- 5 / 83577
bone marrow 5 / 14774 1 / 29891 6554 / 5047110 10191 / 4978364 5 / 14774 1 / 29891 6554 / 5047110 10191 / 4978364
brain 11 / 506301 84 / 200215 609 / 729526 5162 / 4997811 11 / 506301 84 / 200215 609 / 729526 5162 / 4997811
cartilage 3 / 15965 16 / 37226 -- 766 / 778035 3 / 15965 16 / 37226 -- 766 / 778035
cerebellum     42 / 90885 3201 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 42 / 90885 3201 / 1495938
cerebrum 3 / 198932   -- -- 3 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 7 / 44577 -- -- 1 / 3888 7 / 44577 -- --
colon 15 / 26551 45 / 151167 45 / 98089 1113 / 643586 15 / 26551 45 / 151167 45 / 98089 1113 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 159 / 246043   -- -- 159 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 51 / 128826 20 / 46440 153 / 85898 7738 / 12434232 51 / 128826 20 / 46440 153 / 85898 7738 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 3 / 12721 26 / 45908 -- 1 / 28803 3 / 12721 26 / 45908 --
heart 8 / 76442   89 / 83063 -- 8 / 76442 0 / 1 89 / 83063 --
kidney 4 / 106627 34 / 89898 157 / 155372 127 / 100281 4 / 106627 34 / 89898 157 / 155372 127 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 11 / 96846 75 / 107249 44 / 66308 778 / 214987 11 / 96846 75 / 107249 44 / 66308 778 / 214987
lung 65 / 128150 80 / 170663 319 / 159917 354 / 159059 65 / 128150 80 / 170663 319 / 159917 354 / 159059
lymph node 2 / 62650 7 / 27007 16317 / 5278419 13576 / 4863489 2 / 62650 7 / 27007 16317 / 5278419 13576 / 4863489
lymphoreticular 112 / 17836 86 / 44303 -- -- 112 / 17836 86 / 44303 -- --
mammary gland   30 / 104307 105439 / 43166038 21778 / 30312656 0 / 46553 30 / 104307 105439 / 43166038 21778 / 30312656
muscle 3 / 74039 17 / 27691 76 / 107836 70 / 61270 3 / 74039 17 / 27691 76 / 107836 70 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 41 / 89988 176 / 94887 194 / 179472 1 / 11462 41 / 89988 176 / 94887 194 / 179472
pancreas 10 / 7237 42 / 74930 220 / 85728 143 / 189999 10 / 7237 42 / 74930 220 / 85728 143 / 189999
pancreatic islet 43 / 96524 19 / 30072 -- -- 43 / 96524 19 / 30072 -- --
parathyroid   12 / 20557 -- -- 0 / 24 12 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891 1 / 645 -- -- 2 / 14891 1 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 13 / 241088 13 / 39531 308 / 207348 -- 13 / 241088 13 / 39531 308 / 207348 --
pooled tissue 25 / 276455   -- -- 25 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 26 / 79993 26 / 107080 1030 / 266949 1017 / 491794 26 / 79993 26 / 107080 1030 / 266949 1017 / 491794
retina 2 / 29438 -- 388 / 820326 115 / 88490 2 / 29438 -- 388 / 820326 115 / 88490
salivary gland   11 / 10368 -- -- 0 / 2490 11 / 10368 -- --
skin 10 / 73633 105 / 125377 22462 / 26905847 22938 / 34522313 10 / 73633 105 / 125377 22462 / 26905847 22938 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 7 / 52939   -- -- 7 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 6113 / 6230144 -- -- -- 6113 / 6230144 --
stomach 6 / 26641 31 / 65644 168 / 124767 641 / 448716 6 / 26641 31 / 65644 168 / 124767 641 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 3 / 143630 5 / 100058 -- 14537 / 12372003 3 / 143630 5 / 100058 -- 14537 / 12372003
thymus 4 / 4478   -- -- 4 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 2 / 32606 316 / 115938 339 / 124664 2 / 11737 2 / 32606 316 / 115938 339 / 124664
uncharacterized tissue 42 / 207932 67 / 479819 68 / 21833 140 / 51729 42 / 207932 67 / 479819 68 / 21833 140 / 51729
uterus 4 / 38063 72 / 133582 43438 / 10193077 -- 4 / 38063 72 / 133582 43438 / 10193077 --
vascular 8 / 46250 -- 5353 / 13135050 -- 8 / 46250 -- 5353 / 13135050 --
white blood cells -- -- 905 / 846268 -- -- -- 905 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --