Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.741019Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES     88159 / 114162531 40237 / 109592465 0 / 3316537 0 / 2498449 88159 / 114162531 40237 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     -- 10 / 83577 0 / 16077 0 / 57865 -- 10 / 83577
bone marrow     2160 / 5047110 5920 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 2160 / 5047110 5920 / 4978364
brain     326 / 729526 2964 / 4997811 0 / 506301 0 / 200215 326 / 729526 2964 / 4997811
cartilage     -- 266 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 266 / 778035
cerebellum     113 / 90885 1072 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 113 / 90885 1072 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon     144 / 98089 432 / 643586 0 / 26551 0 / 151167 144 / 98089 432 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye     53 / 85898 1039 / 12434232 0 / 128826 0 / 46440 53 / 85898 1039 / 12434232
gastrointestinal tract     33 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 33 / 45908 --
heart     23 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 23 / 83063 --
kidney     96 / 155372 13 / 100281 0 / 106627 0 / 89898 96 / 155372 13 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver     18 / 66308 204 / 214987 0 / 96846 0 / 107249 18 / 66308 204 / 214987
lung     75 / 159917 92 / 159059 0 / 128150 0 / 170663 75 / 159917 92 / 159059
lymph node     1773 / 5278419 436 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 1773 / 5278419 436 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     66014 / 43166038 11321 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 66014 / 43166038 11321 / 30312656
muscle     33 / 107836 106 / 61270 0 / 74039 0 / 27691 33 / 107836 106 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     67 / 94887 146 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 67 / 94887 146 / 179472
pancreas     75 / 85728 160 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 75 / 85728 160 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta     70 / 207348 -- 0 / 241088 0 / 39531 70 / 207348 --
pooled tissue     -- -- 0 / 276455 0 / 0 -- --
prostate     66 / 266949 326 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 66 / 266949 326 / 491794
retina   -- 553 / 820326 18 / 88490 0 / 29438 -- 553 / 820326 18 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     6484 / 26905847 13400 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 6484 / 26905847 13400 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 939 / 6230144 -- -- -- 939 / 6230144 --
stomach     41 / 124767 231 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 41 / 124767 231 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 2009 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 2009 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     58 / 115938 58 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 58 / 115938 58 / 124664
uncharacterized tissue     4 / 21833 14 / 51729 0 / 207932 0 / 479819 4 / 21833 14 / 51729
uterus     6616 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 6616 / 10193077 --
vascular   -- 1728 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 1728 / 13135050 --
white blood cells -- -- 597 / 846268 -- -- -- 597 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --