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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.740473Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 242 / 3316537 186 / 2498449 2360 / 114162531 4700 / 109592465 242 / 3316537 186 / 2498449 2360 / 114162531 4700 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 5 / 57865 --   1 / 16077 5 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 2 / 14774   35 / 5047110 16 / 4978364 2 / 14774 0 / 29891 35 / 5047110 16 / 4978364
brain 35 / 506301 27 / 200215 77 / 729526 872 / 4997811 35 / 506301 27 / 200215 77 / 729526 872 / 4997811
cartilage 3 / 15965 5 / 37226 -- 7 / 778035 3 / 15965 5 / 37226 -- 7 / 778035
cerebellum 9 / 90353   18 / 90885 659 / 1495938 9 / 90353 0 / 0 18 / 90885 659 / 1495938
cerebrum 11 / 198932   -- -- 11 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   6 / 44577 -- -- 0 / 3888 6 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 13 / 151167 1 / 98089 25 / 643586 1 / 26551 13 / 151167 1 / 98089 25 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 16 / 246043   -- -- 16 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 22 / 128826 4 / 46440 12 / 85898 769 / 12434232 22 / 128826 4 / 46440 12 / 85898 769 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 1 / 12721 4 / 45908 -- 1 / 28803 1 / 12721 4 / 45908 --
heart 7 / 76442   3 / 83063 -- 7 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 9 / 106627 10 / 89898 7 / 155372 3 / 100281 9 / 106627 10 / 89898 7 / 155372 3 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   1 / 107249 11 / 66308 15 / 214987 0 / 96846 1 / 107249 11 / 66308 15 / 214987
lung 7 / 128150 10 / 170663 13 / 159917 10 / 159059 7 / 128150 10 / 170663 13 / 159917 10 / 159059
lymph node 9 / 62650 2 / 27007 311 / 5278419 136 / 4863489 9 / 62650 2 / 27007 311 / 5278419 136 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836   -- -- 1 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   10 / 104307 473 / 43166038 915 / 30312656 0 / 46553 10 / 104307 473 / 43166038 915 / 30312656
muscle 3 / 74039 1 / 27691 2 / 107836 3 / 61270 3 / 74039 1 / 27691 2 / 107836 3 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   10 / 89988 9 / 94887 18 / 179472 0 / 11462 10 / 89988 9 / 94887 18 / 179472
pancreas   10 / 74930 1 / 85728 9 / 189999 0 / 7237 10 / 74930 1 / 85728 9 / 189999
pancreatic islet 5 / 96524 10 / 30072 -- -- 5 / 96524 10 / 30072 -- --
parathyroid   3 / 20557 -- -- 0 / 24 3 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 2 / 6170 -- -- -- 2 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260 2 / 1358 -- -- 2 / 13260 2 / 1358 -- --
placenta 10 / 241088 3 / 39531 13 / 207348 -- 10 / 241088 3 / 39531 13 / 207348 --
pooled tissue 31 / 276455   -- -- 31 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 6 / 79993 1 / 107080 6 / 266949 32 / 491794 6 / 79993 1 / 107080 6 / 266949 32 / 491794
retina 4 / 29438 -- 98 / 820326 7 / 88490 4 / 29438 -- 98 / 820326 7 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 4 / 73633 8 / 125377 391 / 26905847 621 / 34522313 4 / 73633 8 / 125377 391 / 26905847 621 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 254 / 6230144 -- -- -- 254 / 6230144 --
stomach 5 / 26641 1 / 65644 10 / 124767 33 / 448716 5 / 26641 1 / 65644 10 / 124767 33 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 6 / 143630 4 / 100058 -- 534 / 12372003 6 / 143630 4 / 100058 -- 534 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737   5 / 115938 5 / 124664 1 / 11737 0 / 32606 5 / 115938 5 / 124664
uncharacterized tissue 14 / 207932 25 / 479819   11 / 51729 14 / 207932 25 / 479819 0 / 21833 11 / 51729
uterus 8 / 38063 12 / 133582 136 / 10193077 -- 8 / 38063 12 / 133582 136 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 446 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 446 / 13135050 --
white blood cells -- -- 24 / 846268 -- -- -- 24 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --