Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.729340Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 157 / 3316537 25 / 2498449 265 / 114162531 276 / 109592465 157 / 3316537 25 / 2498449 265 / 114162531 276 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     33 / 5047110   0 / 14774 0 / 29891 33 / 5047110 0 / 4978364
brain 19 / 506301     4 / 4997811 19 / 506301 0 / 200215 0 / 729526 4 / 4997811
cartilage     -- 1 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 1 / 778035
cerebellum       3 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 3 / 1495938
cerebrum 10 / 198932   -- -- 10 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon         0 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 1 / 246043   -- -- 1 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye       42 / 12434232 0 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 42 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 3 / 106627 1 / 89898     3 / 106627 1 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver       1 / 214987 0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung     1 / 159917   0 / 128150 0 / 170663 1 / 159917 0 / 159059
lymph node     129 / 5278419 2 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 129 / 5278419 2 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     8 / 43166038 102 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 8 / 43166038 102 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary         0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas     1 / 85728   0 / 7237 0 / 74930 1 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta       -- 0 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 2 / 276455   -- -- 2 / 276455 0 / 0 -- --
prostate     1 / 266949 3 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 1 / 266949 3 / 491794
retina   -- 3 / 820326   0 / 29438 -- 3 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     42 / 26905847 77 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 42 / 26905847 77 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 3 / 6230144 -- -- -- 3 / 6230144 --
stomach       1 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 122 / 143630   -- 40 / 12372003 122 / 143630 0 / 100058 -- 40 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue   23 / 479819     0 / 207932 23 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus     8 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 8 / 10193077 --
vascular   -- 31 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 31 / 13135050 --
white blood cells -- -- 5 / 846268 -- -- -- 5 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --