Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.728762Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 417 / 3316537 146 / 2498449 2104 / 114162531 1942 / 109592465 417 / 3316537 146 / 2498449 2104 / 114162531 1942 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     -- 14 / 83577 0 / 16077 0 / 57865 -- 14 / 83577
bone marrow   1 / 29891 15 / 5047110 1 / 4978364 0 / 14774 1 / 29891 15 / 5047110 1 / 4978364
brain 216 / 506301 47 / 200215 167 / 729526 182 / 4997811 216 / 506301 47 / 200215 167 / 729526 182 / 4997811
cartilage     -- 6 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 6 / 778035
cerebellum 15 / 90353   8 / 90885 78 / 1495938 15 / 90353 0 / 0 8 / 90885 78 / 1495938
cerebrum 76 / 198932   -- -- 76 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 2 / 151167 1 / 98089 5 / 643586 1 / 26551 2 / 151167 1 / 98089 5 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 11 / 246043   -- -- 11 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 17 / 128826 5 / 46440   779 / 12434232 17 / 128826 5 / 46440 0 / 85898 779 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 10 / 76442   3 / 83063 -- 10 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 1 / 106627 7 / 89898 3 / 155372 2 / 100281 1 / 106627 7 / 89898 3 / 155372 2 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   2 / 107249     0 / 96846 2 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 10 / 128150 13 / 170663 1 / 159917   10 / 128150 13 / 170663 1 / 159917 0 / 159059
lymph node     2 / 5278419   0 / 62650 0 / 27007 2 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 3 / 104307 440 / 43166038 382 / 30312656 1 / 46553 3 / 104307 440 / 43166038 382 / 30312656
muscle   2 / 27691   1 / 61270 0 / 74039 2 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   9 / 89988 1 / 94887 1 / 179472 0 / 11462 9 / 89988 1 / 94887 1 / 179472
pancreas   3 / 74930     0 / 7237 3 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 15 / 96524 3 / 30072 -- -- 15 / 96524 3 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 15 / 241088     -- 15 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 12 / 276455   -- -- 12 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   4 / 107080   6 / 491794 0 / 79993 4 / 107080 0 / 266949 6 / 491794
retina   -- 35 / 820326 3 / 88490 0 / 29438 -- 35 / 820326 3 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 7 / 73633 4 / 125377 1150 / 26905847 453 / 34522313 7 / 73633 4 / 125377 1150 / 26905847 453 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 4 / 6230144 -- -- -- 4 / 6230144 --
stomach 3 / 26641     1 / 448716 3 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 4 / 143630 2 / 100058 -- 25 / 12372003 4 / 143630 2 / 100058 -- 25 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606     0 / 11737 1 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue   34 / 479819   3 / 51729 0 / 207932 34 / 479819 0 / 21833 3 / 51729
uterus   3 / 133582 189 / 10193077 -- 0 / 38063 3 / 133582 189 / 10193077 --
vascular   -- 43 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 43 / 13135050 --
white blood cells -- -- 42 / 846268 -- -- -- 42 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --