Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.726537Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 66 / 3316537 113 / 2498449 1183 / 114162531 1141 / 109592465 66 / 3316537 113 / 2498449 1183 / 114162531 1141 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   2 / 57865 -- 1 / 83577 0 / 16077 2 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow 2 / 14774 1 / 29891 290 / 5047110 208 / 4978364 2 / 14774 1 / 29891 290 / 5047110 208 / 4978364
brain 5 / 506301 1 / 200215 4 / 729526 55 / 4997811 5 / 506301 1 / 200215 4 / 729526 55 / 4997811
cartilage     -- 6 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 6 / 778035
cerebellum     2 / 90885 20 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 2 / 90885 20 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   4 / 44577 -- -- 0 / 3888 4 / 44577 -- --
colon   6 / 151167 2 / 98089 16 / 643586 0 / 26551 6 / 151167 2 / 98089 16 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 11 / 246043   -- -- 11 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 1 / 128826 3 / 46440   6 / 12434232 1 / 128826 3 / 46440 0 / 85898 6 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 4 / 76442     -- 4 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 2 / 106627 5 / 89898 1 / 155372 1 / 100281 2 / 106627 5 / 89898 1 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 3 / 107249   7 / 214987 2 / 96846 3 / 107249 0 / 66308 7 / 214987
lung   5 / 170663 1 / 159917 4 / 159059 0 / 128150 5 / 170663 1 / 159917 4 / 159059
lymph node 7 / 62650 3 / 27007 72 / 5278419 54 / 4863489 7 / 62650 3 / 27007 72 / 5278419 54 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   5 / 104307 381 / 43166038 312 / 30312656 0 / 46553 5 / 104307 381 / 43166038 312 / 30312656
muscle   1 / 27691     0 / 74039 1 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   1 / 89988 1 / 94887 1 / 179472 0 / 11462 1 / 89988 1 / 94887 1 / 179472
pancreas   1 / 74930 1 / 85728 4 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 1 / 85728 4 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524   -- -- 2 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 4 / 241088 3 / 39531   -- 4 / 241088 3 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 13 / 276455   -- -- 13 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993 37 / 107080 1 / 266949 10 / 491794 1 / 79993 37 / 107080 1 / 266949 10 / 491794
retina   -- 7 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 7 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 1 / 73633 4 / 125377 208 / 26905847 337 / 34522313 1 / 73633 4 / 125377 208 / 26905847 337 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 5 / 6230144 -- -- -- 5 / 6230144 --
stomach     2 / 124767 6 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 2 / 124767 6 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 3 / 143630 1 / 100058 -- 91 / 12372003 3 / 143630 1 / 100058 -- 91 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     2 / 115938   0 / 11737 0 / 32606 2 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 6 / 207932 18 / 479819   1 / 51729 6 / 207932 18 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 1 / 38063 6 / 133582 155 / 10193077 -- 1 / 38063 6 / 133582 155 / 10193077 --
vascular   -- 39 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 39 / 13135050 --
white blood cells -- -- 9 / 846268 -- -- -- 9 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --