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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.719951Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1186 / 3316537 1191 / 2498449 126355 / 114162531 86687 / 109592465 1186 / 3316537 1191 / 2498449 126355 / 114162531 86687 / 109592465
adrenal cortex -- 5 / 9928 -- -- -- 5 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 5 / 16077 53 / 57865 -- 14 / 83577 5 / 16077 53 / 57865 -- 14 / 83577
bone marrow 6 / 14774 16 / 29891 12439 / 5047110 13586 / 4978364 6 / 14774 16 / 29891 12439 / 5047110 13586 / 4978364
brain 49 / 506301 59 / 200215 559 / 729526 6523 / 4997811 49 / 506301 59 / 200215 559 / 729526 6523 / 4997811
cartilage 7 / 15965 13 / 37226 -- 757 / 778035 7 / 15965 13 / 37226 -- 757 / 778035
cerebellum 8 / 90353   45 / 90885 2613 / 1495938 8 / 90353 0 / 0 45 / 90885 2613 / 1495938
cerebrum 22 / 198932 1 / 3422 -- -- 22 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 24 / 44577 -- -- 1 / 3888 24 / 44577 -- --
colon 10 / 26551 46 / 151167 62 / 98089 920 / 643586 10 / 26551 46 / 151167 62 / 98089 920 / 643586
ear 10 / 16130 -- -- -- 10 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 262 / 246043   -- -- 262 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 6 / 19564 2 / 2857 -- -- 6 / 19564 2 / 2857 -- --
esophagus   4 / 17290 -- -- 0 / 270 4 / 17290 -- --
eye 63 / 128826 28 / 46440 159 / 85898 3273 / 12434232 63 / 128826 28 / 46440 159 / 85898 3273 / 12434232
gastrointestinal tract 14 / 28803 6 / 12721 52 / 45908 -- 14 / 28803 6 / 12721 52 / 45908 --
heart 23 / 76442   64 / 83063 -- 23 / 76442 0 / 1 64 / 83063 --
kidney 11 / 106627 38 / 89898 179 / 155372 109 / 100281 11 / 106627 38 / 89898 179 / 155372 109 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 44 / 96846 69 / 107249 67 / 66308 412 / 214987 44 / 96846 69 / 107249 67 / 66308 412 / 214987
lung 38 / 128150 65 / 170663 281 / 159917 320 / 159059 38 / 128150 65 / 170663 281 / 159917 320 / 159059
lymph node 20 / 62650 26 / 27007 15985 / 5278419 5416 / 4863489 20 / 62650 26 / 27007 15985 / 5278419 5416 / 4863489
lymphoreticular 17 / 17836 44 / 44303 -- -- 17 / 17836 44 / 44303 -- --
mammary gland 29 / 46553 79 / 104307 40216 / 43166038 14376 / 30312656 29 / 46553 79 / 104307 40216 / 43166038 14376 / 30312656
muscle 20 / 74039 30 / 27691 89 / 107836 101 / 61270 20 / 74039 30 / 27691 89 / 107836 101 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 9 / 11462 36 / 89988 105 / 94887 226 / 179472 9 / 11462 36 / 89988 105 / 94887 226 / 179472
pancreas 4 / 7237 32 / 74930 172 / 85728 196 / 189999 4 / 7237 32 / 74930 172 / 85728 196 / 189999
pancreatic islet 30 / 96524 50 / 30072 -- -- 30 / 96524 50 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 7 / 14891 1 / 645 -- -- 7 / 14891 1 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 6 / 13260 1 / 1358 -- -- 6 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 38 / 241088 31 / 39531 228 / 207348 -- 38 / 241088 31 / 39531 228 / 207348 --
pooled tissue 111 / 276455   -- -- 111 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 64 / 79993 75 / 107080 506 / 266949 714 / 491794 64 / 79993 75 / 107080 506 / 266949 714 / 491794
retina 2 / 29438 -- 440 / 820326 83 / 88490 2 / 29438 -- 440 / 820326 83 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 16 / 73633 65 / 125377 13165 / 26905847 20482 / 34522313 16 / 73633 65 / 125377 13165 / 26905847 20482 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 13 / 52939   -- -- 13 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 5652 / 6230144 -- -- -- 5652 / 6230144 --
stomach 12 / 26641 30 / 65644 250 / 124767 744 / 448716 12 / 26641 30 / 65644 250 / 124767 744 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 18 / 143630 15 / 100058 -- 15504 / 12372003 18 / 143630 15 / 100058 -- 15504 / 12372003
thymus 4 / 4478   -- -- 4 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 11 / 11737 24 / 32606 173 / 115938 204 / 124664 11 / 11737 24 / 32606 173 / 115938 204 / 124664
uncharacterized tissue 141 / 207932 141 / 479819 64 / 21833 114 / 51729 141 / 207932 141 / 479819 64 / 21833 114 / 51729
uterus 3 / 38063 78 / 133582 30026 / 10193077 -- 3 / 38063 78 / 133582 30026 / 10193077 --
vascular 20 / 46250 -- 3947 / 13135050 -- 20 / 46250 -- 3947 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1430 / 846268 -- -- -- 1430 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --