Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.709373Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 22 / 3316537 23 / 2498449 82 / 114162531 117 / 109592465 22 / 3316537 23 / 2498449 82 / 114162531 117 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     3 / 5047110   0 / 14774 0 / 29891 3 / 5047110 0 / 4978364
brain 3 / 506301 4 / 200215 12 / 729526 29 / 4997811 3 / 506301 4 / 200215 12 / 729526 29 / 4997811
cartilage   2 / 37226 -- 1 / 778035 0 / 15965 2 / 37226 -- 1 / 778035
cerebellum     1 / 90885 2 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 2 / 1495938
cerebrum 6 / 198932   -- -- 6 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon         0 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 2 / 246043   -- -- 2 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 2 / 128826     13 / 12434232 2 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 13 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney   1 / 89898     0 / 106627 1 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver         0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 1 / 128150 1 / 170663     1 / 128150 1 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node         0 / 62650 0 / 27007 0 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     17 / 43166038 4 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 17 / 43166038 4 / 30312656
muscle 3 / 74039   1 / 107836   3 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary         0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas         0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 2 / 241088     -- 2 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue     -- -- 0 / 276455 0 / 0 -- --
prostate         0 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 0 / 491794
retina   -- 2 / 820326   0 / 29438 -- 2 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     13 / 26905847 19 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 13 / 26905847 19 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 1 / 6230144 -- -- -- 1 / 6230144 --
stomach   1 / 65644     0 / 26641 1 / 65644 0 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 49 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 49 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue   14 / 479819     0 / 207932 14 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus     31 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 31 / 10193077 --
vascular   -- 1 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 1 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --