Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.702139Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 573 / 3316537 349 / 2498449 8829 / 114162531 17300 / 109592465 573 / 3316537 349 / 2498449 8829 / 114162531 17300 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077   -- 9 / 83577 1 / 16077 0 / 57865 -- 9 / 83577
bone marrow     456 / 5047110 154 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 456 / 5047110 154 / 4978364
brain 126 / 506301 29 / 200215 91 / 729526 377 / 4997811 126 / 506301 29 / 200215 91 / 729526 377 / 4997811
cartilage 1 / 15965 1 / 37226 -- 28 / 778035 1 / 15965 1 / 37226 -- 28 / 778035
cerebellum 9 / 90353   3 / 90885 80 / 1495938 9 / 90353 0 / 0 3 / 90885 80 / 1495938
cerebrum 14 / 198932   -- -- 14 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon 6 / 26551 26 / 151167 13 / 98089 52 / 643586 6 / 26551 26 / 151167 13 / 98089 52 / 643586
ear 5 / 16130 -- -- -- 5 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 21 / 246043   -- -- 21 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   4 / 17290 -- -- 0 / 270 4 / 17290 -- --
eye 14 / 128826 1 / 46440 8 / 85898 89 / 12434232 14 / 128826 1 / 46440 8 / 85898 89 / 12434232
gastrointestinal tract 6 / 28803 4 / 12721   -- 6 / 28803 4 / 12721 0 / 45908 --
heart 12 / 76442   1 / 83063 -- 12 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 11 / 106627 4 / 89898 46 / 155372 8 / 100281 11 / 106627 4 / 89898 46 / 155372 8 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 18 / 96846 8 / 107249   9 / 214987 18 / 96846 8 / 107249 0 / 66308 9 / 214987
lung 19 / 128150 28 / 170663 9 / 159917 27 / 159059 19 / 128150 28 / 170663 9 / 159917 27 / 159059
lymph node   1 / 27007 13 / 5278419 2 / 4863489 0 / 62650 1 / 27007 13 / 5278419 2 / 4863489
lymphoreticular 2 / 17836   -- -- 2 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 7 / 46553 29 / 104307 7111 / 43166038 15955 / 30312656 7 / 46553 29 / 104307 7111 / 43166038 15955 / 30312656
muscle 4 / 74039 2 / 27691 7 / 107836   4 / 74039 2 / 27691 7 / 107836 0 / 61270
nervous 30 / 10333   -- -- 30 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   8 / 89988 4 / 94887 10 / 179472 0 / 11462 8 / 89988 4 / 94887 10 / 179472
pancreas   12 / 74930 11 / 85728 29 / 189999 0 / 7237 12 / 74930 11 / 85728 29 / 189999
pancreatic islet 31 / 96524 2 / 30072 -- -- 31 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 37 / 14891   -- -- 37 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 24 / 241088 1 / 39531 1 / 207348 -- 24 / 241088 1 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 1 / 276455   -- -- 1 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 25 / 79993 28 / 107080 11 / 266949 55 / 491794 25 / 79993 28 / 107080 11 / 266949 55 / 491794
retina 12 / 29438 -- 14 / 820326   12 / 29438 -- 14 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 6 / 73633 45 / 125377 411 / 26905847 204 / 34522313 6 / 73633 45 / 125377 411 / 26905847 204 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 13 / 52939   -- -- 13 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 35 / 6230144 -- -- -- 35 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 13 / 65644   54 / 448716 2 / 26641 13 / 65644 0 / 124767 54 / 448716
synovium   2 / 1650 -- -- 0 / 249 2 / 1650 -- --
testis 20 / 143630   -- 155 / 12372003 20 / 143630 0 / 100058 -- 155 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 13 / 11737 14 / 32606 2 / 115938   13 / 11737 14 / 32606 2 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 37 / 207932 81 / 479819 2 / 21833 3 / 51729 37 / 207932 81 / 479819 2 / 21833 3 / 51729
uterus 5 / 38063 4 / 133582 311 / 10193077 -- 5 / 38063 4 / 133582 311 / 10193077 --
vascular 4 / 46250 -- 193 / 13135050 -- 4 / 46250 -- 193 / 13135050 --
white blood cells -- -- 76 / 846268 -- -- -- 76 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --