Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.69771Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 344 / 3316537 350 / 2498449 1658 / 114162531 1496 / 109592465 344 / 3316537 350 / 2498449 1658 / 114162531 1496 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   6 / 57865 -- 4 / 83577 0 / 16077 6 / 57865 -- 4 / 83577
bone marrow 1 / 14774       1 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 21 / 506301 6 / 200215 6 / 729526 57 / 4997811 21 / 506301 6 / 200215 6 / 729526 57 / 4997811
cartilage 3 / 15965 4 / 37226 -- 13 / 778035 3 / 15965 4 / 37226 -- 13 / 778035
cerebellum 2 / 90353       2 / 90353 0 / 0 0 / 90885 0 / 1495938
cerebrum 4 / 198932   -- -- 4 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 7 / 44577 -- -- 1 / 3888 7 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 28 / 151167   5 / 643586 2 / 26551 28 / 151167 0 / 98089 5 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 10 / 128826   1 / 85898 12 / 12434232 10 / 128826 0 / 46440 1 / 85898 12 / 12434232
gastrointestinal tract 4 / 28803     -- 4 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 4 / 76442     -- 4 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 6 / 106627 9 / 89898 3 / 155372 1 / 100281 6 / 106627 9 / 89898 3 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 164 / 96846 67 / 107249 10 / 66308 3 / 214987 164 / 96846 67 / 107249 10 / 66308 3 / 214987
lung 15 / 128150 4 / 170663   18 / 159059 15 / 128150 4 / 170663 0 / 159917 18 / 159059
lymph node     110 / 5278419 1 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 110 / 5278419 1 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 4 / 46553 44 / 104307 1380 / 43166038 1157 / 30312656 4 / 46553 44 / 104307 1380 / 43166038 1157 / 30312656
muscle 4 / 74039   1 / 107836   4 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 0 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 35 / 89988   79 / 179472 1 / 11462 35 / 89988 0 / 94887 79 / 179472
pancreas   13 / 74930 1 / 85728 9 / 189999 0 / 7237 13 / 74930 1 / 85728 9 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524   -- -- 2 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 22 / 241088     -- 22 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 15 / 276455   -- -- 15 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 8 / 79993 1 / 107080 2 / 266949 5 / 491794 8 / 79993 1 / 107080 2 / 266949 5 / 491794
retina   -- 4 / 820326   0 / 29438 -- 4 / 820326 0 / 88490
salivary gland 1 / 2490   -- -- 1 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     91 / 26905847 116 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 91 / 26905847 116 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 5 / 52939   -- -- 5 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 3 / 6230144 -- -- -- 3 / 6230144 --
stomach 8 / 26641 26 / 65644 1 / 124767 15 / 448716 8 / 26641 26 / 65644 1 / 124767 15 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 3 / 143630   -- 1 / 12372003 3 / 143630 0 / 100058 -- 1 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 1 / 115938   0 / 11737 1 / 32606 1 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 27 / 207932 14 / 479819     27 / 207932 14 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 1 / 38063 83 / 133582 25 / 10193077 -- 1 / 38063 83 / 133582 25 / 10193077 --
vascular   -- 14 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 14 / 13135050 --
white blood cells -- -- 5 / 846268 -- -- -- 5 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --