Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.683449Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 62 / 3316537 35 / 2498449 70 / 114162531 120 / 109592465 62 / 3316537 35 / 2498449 70 / 114162531 120 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow         0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 14 / 506301 7 / 200215 3 / 729526 39 / 4997811 14 / 506301 7 / 200215 3 / 729526 39 / 4997811
cartilage     --   0 / 15965 0 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum 13 / 90353   3 / 90885 7 / 1495938 13 / 90353 0 / 0 3 / 90885 7 / 1495938
cerebrum 14 / 198932 1 / 3422 -- -- 14 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   1 / 151167     0 / 26551 1 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 4 / 19564   -- -- 4 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 2 / 128826     3 / 12434232 2 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 3 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 4 / 76442     -- 4 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney   1 / 89898     0 / 106627 1 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver         0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 1 / 128150 7 / 170663     1 / 128150 7 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node 2 / 62650   3 / 5278419 1 / 4863489 2 / 62650 0 / 27007 3 / 5278419 1 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     13 / 43166038 12 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 13 / 43166038 12 / 30312656
muscle 2 / 74039       2 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   3 / 89988     0 / 11462 3 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas     1 / 85728   0 / 7237 0 / 74930 1 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet   1 / 30072 -- -- 0 / 96524 1 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 2 / 241088     -- 2 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue     -- -- 0 / 276455 0 / 0 -- --
prostate         0 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 0 / 491794
retina 2 / 29438 -- 1 / 820326   2 / 29438 -- 1 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   1 / 125377 6 / 26905847 58 / 34522313 0 / 73633 1 / 125377 6 / 26905847 58 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 6230144 --
stomach   1 / 65644     0 / 26641 1 / 65644 0 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     --   0 / 143630 0 / 100058 -- 0 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue   11 / 479819     0 / 207932 11 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus     40 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 40 / 10193077 --
vascular   --   -- 0 / 46250 -- 0 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --