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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.657926Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 59 / 3316537 43 / 2498449 1066 / 114162531 1352 / 109592465 59 / 3316537 43 / 2498449 1066 / 114162531 1352 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   2 / 29891 2 / 5047110 29 / 4978364 0 / 14774 2 / 29891 2 / 5047110 29 / 4978364
brain 6 / 506301 3 / 200215 7 / 729526 52 / 4997811 6 / 506301 3 / 200215 7 / 729526 52 / 4997811
cartilage   5 / 37226 -- 2 / 778035 0 / 15965 5 / 37226 -- 2 / 778035
cerebellum 5 / 90353   1 / 90885 30 / 1495938 5 / 90353 0 / 0 1 / 90885 30 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 1 / 151167   2 / 643586 1 / 26551 1 / 151167 0 / 98089 2 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 4 / 246043   -- -- 4 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 2 / 128826 2 / 46440   696 / 12434232 2 / 128826 2 / 46440 0 / 85898 696 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803     -- 2 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 5 / 106627       5 / 106627 0 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 1 / 107249   1 / 214987 3 / 96846 1 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 2 / 128150 2 / 170663 3 / 159917 2 / 159059 2 / 128150 2 / 170663 3 / 159917 2 / 159059
lymph node     250 / 5278419 5 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 250 / 5278419 5 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 2 / 104307 19 / 43166038 127 / 30312656 2 / 46553 2 / 104307 19 / 43166038 127 / 30312656
muscle 3 / 74039       3 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   2 / 89988 1 / 94887   0 / 11462 2 / 89988 1 / 94887 0 / 179472
pancreas   1 / 74930 1 / 85728   0 / 7237 1 / 74930 1 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524   -- -- 2 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 1 / 241088   1 / 207348 -- 1 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 6 / 276455   -- -- 6 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   3 / 107080 1 / 266949   0 / 79993 3 / 107080 1 / 266949 0 / 491794
retina 1 / 29438 -- 11 / 820326 1 / 88490 1 / 29438 -- 11 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 4 / 73633 1 / 125377 321 / 26905847 256 / 34522313 4 / 73633 1 / 125377 321 / 26905847 256 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 49 / 6230144 -- -- -- 49 / 6230144 --
stomach     4 / 124767 4 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 4 / 124767 4 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630 2 / 100058 -- 145 / 12372003 1 / 143630 2 / 100058 -- 145 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     1 / 115938   0 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 3 / 207932 14 / 479819     3 / 207932 14 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   2 / 133582 269 / 10193077 -- 0 / 38063 2 / 133582 269 / 10193077 --
vascular   -- 119 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 119 / 13135050 --
white blood cells -- -- 6 / 846268 -- -- -- 6 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --