Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.656753Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 14 / 3316537 6 / 2498449 1328 / 114162531 1967 / 109592465 14 / 3316537 6 / 2498449 1328 / 114162531 1967 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     18 / 5047110 3 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 18 / 5047110 3 / 4978364
brain 1 / 506301   53 / 729526 85 / 4997811 1 / 506301 0 / 200215 53 / 729526 85 / 4997811
cartilage     -- 13 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 13 / 778035
cerebellum       54 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 54 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon       1 / 643586 0 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 1 / 246043   -- -- 1 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye     1 / 85898 489 / 12434232 0 / 128826 0 / 46440 1 / 85898 489 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 2 / 106627 1 / 89898 1 / 155372   2 / 106627 1 / 89898 1 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver     1 / 66308 2 / 214987 0 / 96846 0 / 107249 1 / 66308 2 / 214987
lung 1 / 128150 2 / 170663   1 / 159059 1 / 128150 2 / 170663 0 / 159917 1 / 159059
lymph node     41 / 5278419 53 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 41 / 5278419 53 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     141 / 43166038 505 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 141 / 43166038 505 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     1 / 94887   0 / 11462 0 / 89988 1 / 94887 0 / 179472
pancreas       2 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 4 / 241088   8 / 207348 -- 4 / 241088 0 / 39531 8 / 207348 --
pooled tissue     -- -- 0 / 276455 0 / 0 -- --
prostate       3 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 3 / 491794
retina 1 / 29438 -- 7 / 820326 1 / 88490 1 / 29438 -- 7 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     219 / 26905847 455 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 219 / 26905847 455 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 530 / 6230144 -- -- -- 530 / 6230144 --
stomach     1 / 124767 2 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 1 / 124767 2 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630   -- 296 / 12372003 2 / 143630 0 / 100058 -- 296 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid       2 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue         0 / 207932 0 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   3 / 133582 28 / 10193077 -- 0 / 38063 3 / 133582 28 / 10193077 --
vascular   -- 271 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 271 / 13135050 --
white blood cells -- -- 7 / 846268 -- -- -- 7 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --