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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.656723Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 187 / 3316537 105 / 2498449 14929 / 114162531 25925 / 109592465 187 / 3316537 105 / 2498449 14929 / 114162531 25925 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   5 / 57865 -- 1 / 83577 0 / 16077 5 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow     87 / 5047110 77 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 87 / 5047110 77 / 4978364
brain 5 / 506301 10 / 200215 55 / 729526 699 / 4997811 5 / 506301 10 / 200215 55 / 729526 699 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 61 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 61 / 778035
cerebellum 2 / 90353   3 / 90885 161 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 3 / 90885 161 / 1495938
cerebrum 65 / 198932   -- -- 65 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon   9 / 151167 12 / 98089 139 / 643586 0 / 26551 9 / 151167 12 / 98089 139 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 12 / 246043   -- -- 12 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 8 / 128826 3 / 46440 3 / 85898 5945 / 12434232 8 / 128826 3 / 46440 3 / 85898 5945 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803 1 / 12721 4 / 45908 -- 3 / 28803 1 / 12721 4 / 45908 --
heart 3 / 76442   19 / 83063 -- 3 / 76442 0 / 1 19 / 83063 --
kidney 4 / 106627 10 / 89898 21 / 155372 18 / 100281 4 / 106627 10 / 89898 21 / 155372 18 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 6 / 96846 12 / 107249 23 / 66308 23 / 214987 6 / 96846 12 / 107249 23 / 66308 23 / 214987
lung 3 / 128150 7 / 170663 37 / 159917 21 / 159059 3 / 128150 7 / 170663 37 / 159917 21 / 159059
lymph node 5 / 62650 2 / 27007 774 / 5278419 1027 / 4863489 5 / 62650 2 / 27007 774 / 5278419 1027 / 4863489
lymphoreticular   2 / 44303 -- -- 0 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 7 / 104307 3863 / 43166038 4430 / 30312656 1 / 46553 7 / 104307 3863 / 43166038 4430 / 30312656
muscle     7 / 107836 3 / 61270 0 / 74039 0 / 27691 7 / 107836 3 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   6 / 89988 27 / 94887 18 / 179472 0 / 11462 6 / 89988 27 / 94887 18 / 179472
pancreas   1 / 74930 18 / 85728 23 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 18 / 85728 23 / 189999
pancreatic islet 7 / 96524   -- -- 7 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 9 / 241088 1 / 39531 35 / 207348 -- 9 / 241088 1 / 39531 35 / 207348 --
pooled tissue 29 / 276455   -- -- 29 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 5 / 79993 10 / 107080 82 / 266949 101 / 491794 5 / 79993 10 / 107080 82 / 266949 101 / 491794
retina   -- 130 / 820326 10 / 88490 0 / 29438 -- 130 / 820326 10 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 3 / 73633 5 / 125377 4662 / 26905847 10315 / 34522313 3 / 73633 5 / 125377 4662 / 26905847 10315 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 968 / 6230144 -- -- -- 968 / 6230144 --
stomach   1 / 65644 41 / 124767 106 / 448716 0 / 26641 1 / 65644 41 / 124767 106 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 2689 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 2689 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     20 / 115938 34 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 20 / 115938 34 / 124664
uncharacterized tissue 4 / 207932 9 / 479819 1 / 21833 24 / 51729 4 / 207932 9 / 479819 1 / 21833 24 / 51729
uterus 8 / 38063 1 / 133582 1239 / 10193077 -- 8 / 38063 1 / 133582 1239 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 2741 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 2741 / 13135050 --
white blood cells -- -- 57 / 846268 -- -- -- 57 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --