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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.656657Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 152 / 3316537 98 / 2498449 1449 / 114162531 1105 / 109592465 152 / 3316537 98 / 2498449 1449 / 114162531 1105 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 -- 2 / 83577 0 / 16077 1 / 57865 -- 2 / 83577
bone marrow   1 / 29891   30 / 4978364 0 / 14774 1 / 29891 0 / 5047110 30 / 4978364
brain 31 / 506301 6 / 200215 32 / 729526 64 / 4997811 31 / 506301 6 / 200215 32 / 729526 64 / 4997811
cartilage 4 / 15965 3 / 37226 -- 62 / 778035 4 / 15965 3 / 37226 -- 62 / 778035
cerebellum 3 / 90353   1 / 90885 6 / 1495938 3 / 90353 0 / 0 1 / 90885 6 / 1495938
cerebrum 5 / 198932 1 / 3422 -- -- 5 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 2 / 151167 7 / 98089 3 / 643586 1 / 26551 2 / 151167 7 / 98089 3 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 8 / 246043   -- -- 8 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 6 / 128826 2 / 46440 1 / 85898 61 / 12434232 6 / 128826 2 / 46440 1 / 85898 61 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803     -- 2 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 4 / 76442     -- 4 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 8 / 106627 3 / 89898 3 / 155372 1 / 100281 8 / 106627 3 / 89898 3 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   3 / 107249     0 / 96846 3 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 7 / 128150 7 / 170663 2 / 159917 1 / 159059 7 / 128150 7 / 170663 2 / 159917 1 / 159059
lymph node   1 / 27007 8 / 5278419   0 / 62650 1 / 27007 8 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 9 / 46553 15 / 104307 635 / 43166038 395 / 30312656 9 / 46553 15 / 104307 635 / 43166038 395 / 30312656
muscle 2 / 74039   1 / 107836   2 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 0 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   7 / 89988 5 / 94887 6 / 179472 0 / 11462 7 / 89988 5 / 94887 6 / 179472
pancreas   1 / 74930 1 / 85728 3 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 1 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524   -- -- 4 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 2 / 6170 -- -- -- 2 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 2 / 241088 1 / 39531 1 / 207348 -- 2 / 241088 1 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 8 / 276455   -- -- 8 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 1 / 107080 2 / 266949 8 / 491794 2 / 79993 1 / 107080 2 / 266949 8 / 491794
retina   -- 6 / 820326   0 / 29438 -- 6 / 820326 0 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 6 / 73633 1 / 125377 327 / 26905847 314 / 34522313 6 / 73633 1 / 125377 327 / 26905847 314 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 102 / 6230144 -- -- -- 102 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 1 / 65644 1 / 124767 8 / 448716 1 / 26641 1 / 65644 1 / 124767 8 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 4 / 143630 17 / 100058 -- 139 / 12372003 4 / 143630 17 / 100058 -- 139 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 5 / 11737 2 / 32606 2 / 115938 2 / 124664 5 / 11737 2 / 32606 2 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 14 / 207932 15 / 479819 2 / 21833   14 / 207932 15 / 479819 2 / 21833 0 / 51729
uterus 1 / 38063 1 / 133582 70 / 10193077 -- 1 / 38063 1 / 133582 70 / 10193077 --
vascular 7 / 46250 -- 225 / 13135050 -- 7 / 46250 -- 225 / 13135050 --
white blood cells -- -- 15 / 846268 -- -- -- 15 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --