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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.656395Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 93 / 3316537 59 / 2498449 1227 / 114162531 2177 / 109592465 93 / 3316537 59 / 2498449 1227 / 114162531 2177 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   1 / 29891 17 / 5047110 10 / 4978364 0 / 14774 1 / 29891 17 / 5047110 10 / 4978364
brain 6 / 506301   13 / 729526 112 / 4997811 6 / 506301 0 / 200215 13 / 729526 112 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 6 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 6 / 778035
cerebellum 1 / 90353     26 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 0 / 90885 26 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 7 / 151167   10 / 643586 1 / 26551 7 / 151167 0 / 98089 10 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 3 / 246043   -- -- 3 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 5 / 128826     689 / 12434232 5 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 689 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 9 / 106627 2 / 89898 3 / 155372 1 / 100281 9 / 106627 2 / 89898 3 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 1 / 107249   2 / 214987 1 / 96846 1 / 107249 0 / 66308 2 / 214987
lung 9 / 128150   3 / 159917 3 / 159059 9 / 128150 0 / 170663 3 / 159917 3 / 159059
lymph node     48 / 5278419 33 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 48 / 5278419 33 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   3 / 104307 240 / 43166038 548 / 30312656 0 / 46553 3 / 104307 240 / 43166038 548 / 30312656
muscle 15 / 74039 2 / 27691 1 / 107836 1 / 61270 15 / 74039 2 / 27691 1 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   5 / 89988   1 / 179472 0 / 11462 5 / 89988 0 / 94887 1 / 179472
pancreas   2 / 74930 1 / 85728 2 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 1 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet 3 / 96524   -- -- 3 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 10 / 241088   4 / 207348 -- 10 / 241088 0 / 39531 4 / 207348 --
pooled tissue 8 / 276455   -- -- 8 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 4 / 79993   6 / 266949 7 / 491794 4 / 79993 0 / 107080 6 / 266949 7 / 491794
retina   -- 33 / 820326 6 / 88490 0 / 29438 -- 33 / 820326 6 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   1 / 125377 501 / 26905847 620 / 34522313 0 / 73633 1 / 125377 501 / 26905847 620 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 51 / 6230144 -- -- -- 51 / 6230144 --
stomach 3 / 26641 3 / 65644 2 / 124767 17 / 448716 3 / 26641 3 / 65644 2 / 124767 17 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis   5 / 100058 -- 80 / 12372003 0 / 143630 5 / 100058 -- 80 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     3 / 115938 3 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 3 / 115938 3 / 124664
uncharacterized tissue 6 / 207932 16 / 479819 1 / 21833   6 / 207932 16 / 479819 1 / 21833 0 / 51729
uterus 4 / 38063 9 / 133582 67 / 10193077 -- 4 / 38063 9 / 133582 67 / 10193077 --
vascular 3 / 46250 -- 207 / 13135050 -- 3 / 46250 -- 207 / 13135050 --
white blood cells -- -- 26 / 846268 -- -- -- 26 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --