Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.656Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 52 / 3316537 81 / 2498449 842 / 114162531 1656 / 109592465 52 / 3316537 81 / 2498449 842 / 114162531 1656 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   5 / 57865 --   0 / 16077 5 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     117 / 5047110 104 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 117 / 5047110 104 / 4978364
brain 1 / 506301 6 / 200215 1 / 729526 44 / 4997811 1 / 506301 6 / 200215 1 / 729526 44 / 4997811
cartilage     -- 2 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 2 / 778035
cerebellum       24 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 24 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon   7 / 151167   4 / 643586 0 / 26551 7 / 151167 0 / 98089 4 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 2 / 246043   -- -- 2 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 3 / 128826     871 / 12434232 3 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 871 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 4 / 76442     -- 4 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney       8 / 100281 0 / 106627 0 / 89898 0 / 155372 8 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   4 / 107249   4 / 214987 0 / 96846 4 / 107249 0 / 66308 4 / 214987
lung   1 / 170663 1 / 159917   0 / 128150 1 / 170663 1 / 159917 0 / 159059
lymph node 4 / 62650 1 / 27007 126 / 5278419 46 / 4863489 4 / 62650 1 / 27007 126 / 5278419 46 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836   -- -- 1 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   3 / 104307 122 / 43166038 205 / 30312656 0 / 46553 3 / 104307 122 / 43166038 205 / 30312656
muscle       2 / 61270 0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 2 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   1 / 89988   1 / 179472 0 / 11462 1 / 89988 0 / 94887 1 / 179472
pancreas   1 / 74930     0 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 6 / 241088 1 / 39531 3 / 207348 -- 6 / 241088 1 / 39531 3 / 207348 --
pooled tissue 18 / 276455   -- -- 18 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   1 / 107080 6 / 266949 6 / 491794 0 / 79993 1 / 107080 6 / 266949 6 / 491794
retina   -- 4 / 820326 5 / 88490 0 / 29438 -- 4 / 820326 5 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   3 / 125377 51 / 26905847 89 / 34522313 0 / 73633 3 / 125377 51 / 26905847 89 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 174 / 6230144 -- -- -- 174 / 6230144 --
stomach     3 / 124767 28 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 3 / 124767 28 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 11 / 143630 7 / 100058 -- 212 / 12372003 11 / 143630 7 / 100058 -- 212 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     1 / 115938 1 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 2 / 207932 19 / 479819     2 / 207932 19 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   20 / 133582 102 / 10193077 -- 0 / 38063 20 / 133582 102 / 10193077 --
vascular   -- 129 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 129 / 13135050 --
white blood cells -- -- 2 / 846268 -- -- -- 2 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --