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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.655782Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 333 / 3316537 343 / 2498449 13196 / 114162531 15597 / 109592465 333 / 3316537 343 / 2498449 13196 / 114162531 15597 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 8 / 57865 --   1 / 16077 8 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 4 / 14774 8 / 29891 41 / 5047110 20 / 4978364 4 / 14774 8 / 29891 41 / 5047110 20 / 4978364
brain 49 / 506301 25 / 200215 15 / 729526 199 / 4997811 49 / 506301 25 / 200215 15 / 729526 199 / 4997811
cartilage 5 / 15965 2 / 37226 -- 2 / 778035 5 / 15965 2 / 37226 -- 2 / 778035
cerebellum 9 / 90353   1 / 90885 77 / 1495938 9 / 90353 0 / 0 1 / 90885 77 / 1495938
cerebrum 9 / 198932   -- -- 9 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 4 / 44577 -- -- 1 / 3888 4 / 44577 -- --
colon 4 / 26551 16 / 151167   6 / 643586 4 / 26551 16 / 151167 0 / 98089 6 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 32 / 246043   -- -- 32 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 4 / 19564 4 / 2857 -- -- 4 / 19564 4 / 2857 -- --
esophagus   4 / 17290 -- -- 0 / 270 4 / 17290 -- --
eye 6 / 128826 6 / 46440 3 / 85898 2285 / 12434232 6 / 128826 6 / 46440 3 / 85898 2285 / 12434232
gastrointestinal tract 5 / 28803 3 / 12721 2 / 45908 -- 5 / 28803 3 / 12721 2 / 45908 --
heart 11 / 76442     -- 11 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 8 / 106627 6 / 89898 6 / 155372   8 / 106627 6 / 89898 6 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 17 / 96846 12 / 107249 6 / 66308 15 / 214987 17 / 96846 12 / 107249 6 / 66308 15 / 214987
lung 13 / 128150 11 / 170663 10 / 159917 14 / 159059 13 / 128150 11 / 170663 10 / 159917 14 / 159059
lymph node 6 / 62650 4 / 27007 712 / 5278419 447 / 4863489 6 / 62650 4 / 27007 712 / 5278419 447 / 4863489
lymphoreticular   9 / 44303 -- -- 0 / 17836 9 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 20 / 104307 80 / 43166038 3043 / 30312656 1 / 46553 20 / 104307 80 / 43166038 3043 / 30312656
muscle 7 / 74039 2 / 27691 3 / 107836 5 / 61270 7 / 74039 2 / 27691 3 / 107836 5 / 61270
nervous 5 / 10333   -- -- 5 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   2 / 89988 4 / 94887 11 / 179472 0 / 11462 2 / 89988 4 / 94887 11 / 179472
pancreas   7 / 74930   3 / 189999 0 / 7237 7 / 74930 0 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 14 / 96524 6 / 30072 -- -- 14 / 96524 6 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 25 / 241088 3 / 39531 21 / 207348 -- 25 / 241088 3 / 39531 21 / 207348 --
pooled tissue 17 / 276455   -- -- 17 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 4 / 79993 3 / 107080 29 / 266949 6 / 491794 4 / 79993 3 / 107080 29 / 266949 6 / 491794
retina 1 / 29438 -- 60 / 820326 1 / 88490 1 / 29438 -- 60 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 3 / 73633 11 / 125377 6766 / 26905847 8680 / 34522313 3 / 73633 11 / 125377 6766 / 26905847 8680 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 5 / 52939   -- -- 5 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 1541 / 6230144 -- -- -- 1541 / 6230144 --
stomach   34 / 65644 6 / 124767 14 / 448716 0 / 26641 34 / 65644 6 / 124767 14 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 7 / 143630 11 / 100058 -- 767 / 12372003 7 / 143630 11 / 100058 -- 767 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   6 / 32606 19 / 115938   0 / 11737 6 / 32606 19 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 33 / 207932 105 / 479819   2 / 51729 33 / 207932 105 / 479819 0 / 21833 2 / 51729
uterus 3 / 38063 10 / 133582 441 / 10193077 -- 3 / 38063 10 / 133582 441 / 10193077 --
vascular 16 / 46250 -- 3408 / 13135050 -- 16 / 46250 -- 3408 / 13135050 --
white blood cells -- -- 22 / 846268 -- -- -- 22 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --