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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.655380Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 21 / 3316537 15 / 2498449 672 / 114162531 801 / 109592465 21 / 3316537 15 / 2498449 672 / 114162531 801 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     2 / 5047110 10 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 2 / 5047110 10 / 4978364
brain 2 / 506301   6 / 729526 35 / 4997811 2 / 506301 0 / 200215 6 / 729526 35 / 4997811
cartilage     --   0 / 15965 0 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum 3 / 90353   4 / 90885 10 / 1495938 3 / 90353 0 / 0 4 / 90885 10 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   1 / 151167   1 / 643586 0 / 26551 1 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 1 / 246043   -- -- 1 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 4 / 128826     118 / 12434232 4 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 118 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 4 / 106627 1 / 89898 1 / 155372 1 / 100281 4 / 106627 1 / 89898 1 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846   1 / 66308 3 / 214987 1 / 96846 0 / 107249 1 / 66308 3 / 214987
lung   1 / 170663     0 / 128150 1 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node     56 / 5278419   0 / 62650 0 / 27007 56 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 1 / 104307 194 / 43166038 87 / 30312656 1 / 46553 1 / 104307 194 / 43166038 87 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   4 / 89988   1 / 179472 0 / 11462 4 / 89988 0 / 94887 1 / 179472
pancreas   1 / 74930 3 / 85728   0 / 7237 1 / 74930 3 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta     3 / 207348 -- 0 / 241088 0 / 39531 3 / 207348 --
pooled tissue 2 / 276455   -- -- 2 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993     3 / 491794 1 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 3 / 491794
retina   -- 26 / 820326   0 / 29438 -- 26 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     127 / 26905847 440 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 127 / 26905847 440 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 10 / 6230144 -- -- -- 10 / 6230144 --
stomach   1 / 65644 2 / 124767 5 / 448716 0 / 26641 1 / 65644 2 / 124767 5 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 87 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 87 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     1 / 115938   0 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 2 / 207932 4 / 479819     2 / 207932 4 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   1 / 133582 209 / 10193077 -- 0 / 38063 1 / 133582 209 / 10193077 --
vascular   -- 26 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 26 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1 / 846268 -- -- -- 1 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --