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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.655327Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 502 / 3316537 337 / 2498449 31309 / 114162531 27553 / 109592465 502 / 3316537 337 / 2498449 31309 / 114162531 27553 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 15 / 57865 -- 62 / 83577 2 / 16077 15 / 57865 -- 62 / 83577
bone marrow 12 / 14774 4 / 29891 8674 / 5047110 2531 / 4978364 12 / 14774 4 / 29891 8674 / 5047110 2531 / 4978364
brain 26 / 506301 22 / 200215 120 / 729526 2070 / 4997811 26 / 506301 22 / 200215 120 / 729526 2070 / 4997811
cartilage 2 / 15965 6 / 37226 -- 354 / 778035 2 / 15965 6 / 37226 -- 354 / 778035
cerebellum 5 / 90353   21 / 90885 615 / 1495938 5 / 90353 0 / 0 21 / 90885 615 / 1495938
cerebrum 7 / 198932   -- -- 7 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 15 / 151167 6 / 98089 72 / 643586 2 / 26551 15 / 151167 6 / 98089 72 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 57 / 246043   -- -- 57 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 20 / 128826 3 / 46440 22 / 85898 2144 / 12434232 20 / 128826 3 / 46440 22 / 85898 2144 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803   4 / 45908 -- 3 / 28803 0 / 12721 4 / 45908 --
heart 28 / 76442   21 / 83063 -- 28 / 76442 0 / 1 21 / 83063 --
kidney 10 / 106627 12 / 89898 35 / 155372 8 / 100281 10 / 106627 12 / 89898 35 / 155372 8 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 18 / 96846 23 / 107249 6 / 66308 32 / 214987 18 / 96846 23 / 107249 6 / 66308 32 / 214987
lung 27 / 128150 20 / 170663 52 / 159917 25 / 159059 27 / 128150 20 / 170663 52 / 159917 25 / 159059
lymph node 4 / 62650 16 / 27007 2507 / 5278419 1676 / 4863489 4 / 62650 16 / 27007 2507 / 5278419 1676 / 4863489
lymphoreticular 11 / 17836 2 / 44303 -- -- 11 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 17 / 104307 3160 / 43166038 7165 / 30312656 1 / 46553 17 / 104307 3160 / 43166038 7165 / 30312656
muscle 10 / 74039 6 / 27691 21 / 107836 19 / 61270 10 / 74039 6 / 27691 21 / 107836 19 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 18 / 89988 19 / 94887 31 / 179472 2 / 11462 18 / 89988 19 / 94887 31 / 179472
pancreas   2 / 74930 14 / 85728 46 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 14 / 85728 46 / 189999
pancreatic islet 8 / 96524 10 / 30072 -- -- 8 / 96524 10 / 30072 -- --
parathyroid   6 / 20557 -- -- 0 / 24 6 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 11 / 13260 2 / 1358 -- -- 11 / 13260 2 / 1358 -- --
placenta 23 / 241088 3 / 39531 85 / 207348 -- 23 / 241088 3 / 39531 85 / 207348 --
pooled tissue 44 / 276455   -- -- 44 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 28 / 79993 12 / 107080 136 / 266949 149 / 491794 28 / 79993 12 / 107080 136 / 266949 149 / 491794
retina 4 / 29438 -- 160 / 820326 37 / 88490 4 / 29438 -- 160 / 820326 37 / 88490
salivary gland   3 / 10368 -- -- 0 / 2490 3 / 10368 -- --
skin 1 / 73633 20 / 125377 6162 / 26905847 7104 / 34522313 1 / 73633 20 / 125377 6162 / 26905847 7104 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 9 / 52939   -- -- 9 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 2165 / 6230144 -- -- -- 2165 / 6230144 --
stomach 12 / 26641 2 / 65644 17 / 124767 79 / 448716 12 / 26641 2 / 65644 17 / 124767 79 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 18 / 143630 5 / 100058 -- 3236 / 12372003 18 / 143630 5 / 100058 -- 3236 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 5 / 11737 34 / 32606 90 / 115938 86 / 124664 5 / 11737 34 / 32606 90 / 115938 86 / 124664
uncharacterized tissue 68 / 207932 31 / 479819   12 / 51729 68 / 207932 31 / 479819 0 / 21833 12 / 51729
uterus 1 / 38063 23 / 133582 4545 / 10193077 -- 1 / 38063 23 / 133582 4545 / 10193077 --
vascular 17 / 46250 -- 2955 / 13135050 -- 17 / 46250 -- 2955 / 13135050 --
white blood cells -- -- 312 / 846268 -- -- -- 312 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --