Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.655235Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 2 / 3316537 3 / 2498449 202 / 114162531 157 / 109592465 2 / 3316537 3 / 2498449 202 / 114162531 157 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     15 / 5047110 11 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 15 / 5047110 11 / 4978364
brain       10 / 4997811 0 / 506301 0 / 200215 0 / 729526 10 / 4997811
cartilage     -- 3 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 3 / 778035
cerebellum       6 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 6 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon     1 / 98089   0 / 26551 0 / 151167 1 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye       53 / 12434232 0 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 53 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney         0 / 106627 0 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver         0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung     1 / 159917 2 / 159059 0 / 128150 0 / 170663 1 / 159917 2 / 159059
lymph node     32 / 5278419 3 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 32 / 5278419 3 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     132 / 43166038 22 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 132 / 43166038 22 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary       2 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 2 / 179472
pancreas       3 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta       -- 0 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue     -- -- 0 / 276455 0 / 0 -- --
prostate     3 / 266949 6 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 3 / 266949 6 / 491794
retina   -- 2 / 820326   0 / 29438 -- 2 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     10 / 26905847 25 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 10 / 26905847 25 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 3 / 6230144 -- -- -- 3 / 6230144 --
stomach   1 / 65644     0 / 26641 1 / 65644 0 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630   -- 10 / 12372003 1 / 143630 0 / 100058 -- 10 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid       1 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 1 / 207932 2 / 479819     1 / 207932 2 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus     3 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 3 / 10193077 --
vascular   --   -- 0 / 46250 -- 0 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --