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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.654989Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 80 / 3316537 64 / 2498449 2151 / 114162531 2709 / 109592465 80 / 3316537 64 / 2498449 2151 / 114162531 2709 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 4 / 57865 --   2 / 16077 4 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774   38 / 5047110 8 / 4978364 1 / 14774 0 / 29891 38 / 5047110 8 / 4978364
brain 3 / 506301 9 / 200215 8 / 729526 152 / 4997811 3 / 506301 9 / 200215 8 / 729526 152 / 4997811
cartilage     -- 11 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 11 / 778035
cerebellum     1 / 90885 40 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 40 / 1495938
cerebrum 3 / 198932   -- -- 3 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 3 / 151167 2 / 98089 25 / 643586 1 / 26551 3 / 151167 2 / 98089 25 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 10 / 246043   -- -- 10 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 3 / 19564   -- -- 3 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 1 / 128826   1 / 85898 608 / 12434232 1 / 128826 0 / 46440 1 / 85898 608 / 12434232
gastrointestinal tract   1 / 12721   -- 0 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart     2 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 1 / 106627 2 / 89898 2 / 155372 3 / 100281 1 / 106627 2 / 89898 2 / 155372 3 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 4 / 107249 1 / 66308 1 / 214987 1 / 96846 4 / 107249 1 / 66308 1 / 214987
lung   4 / 170663 2 / 159917 7 / 159059 0 / 128150 4 / 170663 2 / 159917 7 / 159059
lymph node 1 / 62650 2 / 27007 119 / 5278419 78 / 4863489 1 / 62650 2 / 27007 119 / 5278419 78 / 4863489
lymphoreticular   2 / 44303 -- -- 0 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland   2 / 104307 413 / 43166038 763 / 30312656 0 / 46553 2 / 104307 413 / 43166038 763 / 30312656
muscle   1 / 27691   1 / 61270 0 / 74039 1 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   2 / 89988   7 / 179472 0 / 11462 2 / 89988 0 / 94887 7 / 179472
pancreas   1 / 74930   3 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 9 / 96524 4 / 30072 -- -- 9 / 96524 4 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 10 / 241088   1 / 207348 -- 10 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 17 / 276455   -- -- 17 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 3 / 79993 5 / 107080 7 / 266949 5 / 491794 3 / 79993 5 / 107080 7 / 266949 5 / 491794
retina   -- 10 / 820326 8 / 88490 0 / 29438 -- 10 / 820326 8 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 1 / 73633 2 / 125377 422 / 26905847 380 / 34522313 1 / 73633 2 / 125377 422 / 26905847 380 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 383 / 6230144 -- -- -- 383 / 6230144 --
stomach   2 / 65644 1 / 124767 12 / 448716 0 / 26641 2 / 65644 1 / 124767 12 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630 2 / 100058 -- 595 / 12372003 2 / 143630 2 / 100058 -- 595 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 2 / 115938 1 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 2 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue   6 / 479819   1 / 51729 0 / 207932 6 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 3 / 38063 5 / 133582 131 / 10193077 -- 3 / 38063 5 / 133582 131 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 568 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 568 / 13135050 --
white blood cells -- -- 37 / 846268 -- -- -- 37 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --