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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.654720Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 110 / 3316537 120 / 2498449 726 / 114162531 579 / 109592465 110 / 3316537 120 / 2498449 726 / 114162531 579 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   7 / 57865 -- 3 / 83577 0 / 16077 7 / 57865 -- 3 / 83577
bone marrow     69 / 5047110 144 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 69 / 5047110 144 / 4978364
brain 11 / 506301 10 / 200215 6 / 729526 49 / 4997811 11 / 506301 10 / 200215 6 / 729526 49 / 4997811
cartilage   3 / 37226 -- 11 / 778035 0 / 15965 3 / 37226 -- 11 / 778035
cerebellum 2 / 90353     4 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 0 / 90885 4 / 1495938
cerebrum 10 / 198932   -- -- 10 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   5 / 44577 -- -- 0 / 3888 5 / 44577 -- --
colon   2 / 151167   4 / 643586 0 / 26551 2 / 151167 0 / 98089 4 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 21 / 246043   -- -- 21 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 6 / 128826 3 / 46440   38 / 12434232 6 / 128826 3 / 46440 0 / 85898 38 / 12434232
gastrointestinal tract     1 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart 1 / 76442     -- 1 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 4 / 106627 1 / 89898   1 / 100281 4 / 106627 1 / 89898 0 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 3 / 107249     2 / 96846 3 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 3 / 128150 10 / 170663   5 / 159059 3 / 128150 10 / 170663 0 / 159917 5 / 159059
lymph node 1 / 62650   45 / 5278419 5 / 4863489 1 / 62650 0 / 27007 45 / 5278419 5 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 2 / 44303 -- -- 1 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 6 / 104307 402 / 43166038 84 / 30312656 2 / 46553 6 / 104307 402 / 43166038 84 / 30312656
muscle 3 / 74039 1 / 27691     3 / 74039 1 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   3 / 89988 1 / 94887   0 / 11462 3 / 89988 1 / 94887 0 / 179472
pancreas       3 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet   3 / 30072 -- -- 0 / 96524 3 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 10 / 241088 1 / 39531 1 / 207348 -- 10 / 241088 1 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 7 / 276455   -- -- 7 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993 3 / 107080   2 / 491794 1 / 79993 3 / 107080 0 / 266949 2 / 491794
retina   -- 4 / 820326   0 / 29438 -- 4 / 820326 0 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin 2 / 73633 26 / 125377 37 / 26905847 164 / 34522313 2 / 73633 26 / 125377 37 / 26905847 164 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 22 / 6230144 -- -- -- 22 / 6230144 --
stomach   3 / 65644   9 / 448716 0 / 26641 3 / 65644 0 / 124767 9 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 5 / 143630 7 / 100058 -- 51 / 12372003 5 / 143630 7 / 100058 -- 51 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     1 / 115938   0 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 9 / 207932 19 / 479819   2 / 51729 9 / 207932 19 / 479819 0 / 21833 2 / 51729
uterus 1 / 38063   83 / 10193077 -- 1 / 38063 0 / 133582 83 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 41 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 41 / 13135050 --
white blood cells -- -- 13 / 846268 -- -- -- 13 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --