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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.654644Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 114 / 3316537 69 / 2498449 246 / 114162531 558 / 109592465 114 / 3316537 69 / 2498449 246 / 114162531 558 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow         0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 28 / 506301 5 / 200215 14 / 729526 54 / 4997811 28 / 506301 5 / 200215 14 / 729526 54 / 4997811
cartilage   1 / 37226 --   0 / 15965 1 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum 13 / 90353   2 / 90885 56 / 1495938 13 / 90353 0 / 0 2 / 90885 56 / 1495938
cerebrum 16 / 198932 1 / 3422 -- -- 16 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon   5 / 151167 2 / 98089 3 / 643586 0 / 26551 5 / 151167 2 / 98089 3 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 4 / 246043   -- -- 4 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 3 / 128826     21 / 12434232 3 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 21 / 12434232
gastrointestinal tract   1 / 12721   -- 0 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart 1 / 76442     -- 1 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 1 / 106627 2 / 89898 2 / 155372 1 / 100281 1 / 106627 2 / 89898 2 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 2 / 107249   3 / 214987 3 / 96846 2 / 107249 0 / 66308 3 / 214987
lung 3 / 128150 3 / 170663 2 / 159917 2 / 159059 3 / 128150 3 / 170663 2 / 159917 2 / 159059
lymph node 8 / 62650   63 / 5278419 12 / 4863489 8 / 62650 0 / 27007 63 / 5278419 12 / 4863489
lymphoreticular   3 / 44303 -- -- 0 / 17836 3 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553 1 / 104307 10 / 43166038 277 / 30312656 3 / 46553 1 / 104307 10 / 43166038 277 / 30312656
muscle   1 / 27691 1 / 107836   0 / 74039 1 / 27691 1 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   2 / 89988 3 / 94887 1 / 179472 0 / 11462 2 / 89988 3 / 94887 1 / 179472
pancreas   1 / 74930 1 / 85728 2 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 1 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891   -- -- 3 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 2 / 241088 2 / 39531 3 / 207348 -- 2 / 241088 2 / 39531 3 / 207348 --
pooled tissue 7 / 276455   -- -- 7 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993 4 / 107080 2 / 266949 8 / 491794 1 / 79993 4 / 107080 2 / 266949 8 / 491794
retina   -- 7 / 820326   0 / 29438 -- 7 / 820326 0 / 88490
salivary gland 1 / 2490   -- -- 1 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 3 / 73633 2 / 125377 38 / 26905847 43 / 34522313 3 / 73633 2 / 125377 38 / 26905847 43 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 9 / 6230144 -- -- -- 9 / 6230144 --
stomach   2 / 65644 2 / 124767 4 / 448716 0 / 26641 2 / 65644 2 / 124767 4 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 5 / 143630 11 / 100058 -- 69 / 12372003 5 / 143630 11 / 100058 -- 69 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606   1 / 124664 0 / 11737 2 / 32606 0 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 5 / 207932 13 / 479819   1 / 51729 5 / 207932 13 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 2 / 38063 2 / 133582 64 / 10193077 -- 2 / 38063 2 / 133582 64 / 10193077 --
vascular   -- 19 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 19 / 13135050 --
white blood cells -- -- 2 / 846268 -- -- -- 2 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --