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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.654469Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 6 / 3316537 7 / 2498449 2997 / 114162531 4090 / 109592465 6 / 3316537 7 / 2498449 2997 / 114162531 4090 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     40 / 5047110 13 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 40 / 5047110 13 / 4978364
brain 1 / 506301   7 / 729526 155 / 4997811 1 / 506301 0 / 200215 7 / 729526 155 / 4997811
cartilage     -- 5 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 5 / 778035
cerebellum     1 / 90885 40 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 40 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon       6 / 643586 0 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 6 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye     1 / 85898 836 / 12434232 0 / 128826 0 / 46440 1 / 85898 836 / 12434232
gastrointestinal tract     1 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney     1 / 155372 3 / 100281 0 / 106627 0 / 89898 1 / 155372 3 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   1 / 107249 1 / 66308 1 / 214987 0 / 96846 1 / 107249 1 / 66308 1 / 214987
lung     8 / 159917 6 / 159059 0 / 128150 0 / 170663 8 / 159917 6 / 159059
lymph node     629 / 5278419 163 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 629 / 5278419 163 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     62 / 43166038 1051 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 62 / 43166038 1051 / 30312656
muscle   4 / 27691     0 / 74039 4 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     1 / 94887 3 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 1 / 94887 3 / 179472
pancreas     2 / 85728 1 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 2 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta     4 / 207348 -- 0 / 241088 0 / 39531 4 / 207348 --
pooled tissue     -- -- 0 / 276455 0 / 0 -- --
prostate     6 / 266949 9 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 6 / 266949 9 / 491794
retina   -- 7 / 820326 5 / 88490 0 / 29438 -- 7 / 820326 5 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     897 / 26905847 1362 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 897 / 26905847 1362 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 180 / 6230144 -- -- -- 180 / 6230144 --
stomach 2 / 26641   1 / 124767 7 / 448716 2 / 26641 0 / 65644 1 / 124767 7 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630   -- 416 / 12372003 1 / 143630 0 / 100058 -- 416 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     6 / 115938 2 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 6 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 1 / 207932 2 / 479819   6 / 51729 1 / 207932 2 / 479819 0 / 21833 6 / 51729
uterus     251 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 251 / 10193077 --
vascular   -- 877 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 877 / 13135050 --
white blood cells -- -- 14 / 846268 -- -- -- 14 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --