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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.654458Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 70 / 3316537 40 / 2498449 51336 / 114162531 4457 / 109592465 70 / 3316537 40 / 2498449 51336 / 114162531 4457 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 1 / 57865 --   3 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     45 / 5047110   0 / 14774 0 / 29891 45 / 5047110 0 / 4978364
brain 1 / 506301 3 / 200215 7 / 729526 26 / 4997811 1 / 506301 3 / 200215 7 / 729526 26 / 4997811
cartilage   11 / 37226 -- 86 / 778035 0 / 15965 11 / 37226 -- 86 / 778035
cerebellum       5 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 5 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   2 / 151167   1 / 643586 0 / 26551 2 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 6 / 128826     4 / 12434232 6 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 4 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart     2 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 2 / 106627 4 / 89898     2 / 106627 4 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver         0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 14 / 128150 11 / 170663 4 / 159917 2 / 159059 14 / 128150 11 / 170663 4 / 159917 2 / 159059
lymph node 1 / 62650   27 / 5278419 3 / 4863489 1 / 62650 0 / 27007 27 / 5278419 3 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836   -- -- 1 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     50794 / 43166038 4206 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 50794 / 43166038 4206 / 30312656
muscle 1 / 74039       1 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462   4 / 94887 2 / 179472 2 / 11462 0 / 89988 4 / 94887 2 / 179472
pancreas         0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 16 / 96524   -- -- 16 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 4 / 241088     -- 4 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 1 / 276455   -- -- 1 / 276455 0 / 0 -- --
prostate     1 / 266949 5 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 1 / 266949 5 / 491794
retina   --     0 / 29438 -- 0 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 6 / 73633 1 / 125377 8 / 26905847 47 / 34522313 6 / 73633 1 / 125377 8 / 26905847 47 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 2 / 6230144 -- -- -- 2 / 6230144 --
stomach         0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 70 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 70 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     2 / 115938   0 / 11737 0 / 32606 2 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 8 / 207932 7 / 479819 1 / 21833   8 / 207932 7 / 479819 1 / 21833 0 / 51729
uterus     24 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 24 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 382 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 382 / 13135050 --
white blood cells -- -- 33 / 846268 -- -- -- 33 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --