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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.654439Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 539 / 3316537 960 / 2498449 43794 / 114162531 52876 / 109592465 539 / 3316537 960 / 2498449 43794 / 114162531 52876 / 109592465
adrenal cortex -- 4 / 9928 -- -- -- 4 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 9 / 57865 -- 153 / 83577 2 / 16077 9 / 57865 -- 153 / 83577
bone marrow     20 / 5047110   0 / 14774 0 / 29891 20 / 5047110 0 / 4978364
brain 108 / 506301 362 / 200215 731 / 729526 11922 / 4997811 108 / 506301 362 / 200215 731 / 729526 11922 / 4997811
cartilage   23 / 37226 -- 134 / 778035 0 / 15965 23 / 37226 -- 134 / 778035
cerebellum 2 / 90353   104 / 90885 553 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 104 / 90885 553 / 1495938
cerebrum 30 / 198932   -- -- 30 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 2 / 44577 -- -- 1 / 3888 2 / 44577 -- --
colon   23 / 151167 2 / 98089 50 / 643586 0 / 26551 23 / 151167 2 / 98089 50 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 66 / 246043   -- -- 66 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 18 / 19564   -- -- 18 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 17 / 128826 3 / 46440 9 / 85898 2906 / 12434232 17 / 128826 3 / 46440 9 / 85898 2906 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 11 / 76442   7 / 83063 -- 11 / 76442 0 / 1 7 / 83063 --
kidney 52 / 106627 65 / 89898 106 / 155372 144 / 100281 52 / 106627 65 / 89898 106 / 155372 144 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 36 / 96846 49 / 107249 241 / 66308 14 / 214987 36 / 96846 49 / 107249 241 / 66308 14 / 214987
lung 10 / 128150 94 / 170663 35 / 159917 114 / 159059 10 / 128150 94 / 170663 35 / 159917 114 / 159059
lymph node   5 / 27007 6211 / 5278419 133 / 4863489 0 / 62650 5 / 27007 6211 / 5278419 133 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   28 / 104307 17986 / 43166038 19453 / 30312656 0 / 46553 28 / 104307 17986 / 43166038 19453 / 30312656
muscle 2 / 74039     26 / 61270 2 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 26 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 36 / 89988 2 / 94887 128 / 179472 1 / 11462 36 / 89988 2 / 94887 128 / 179472
pancreas   9 / 74930 2 / 85728 79 / 189999 0 / 7237 9 / 74930 2 / 85728 79 / 189999
pancreatic islet 5 / 96524 10 / 30072 -- -- 5 / 96524 10 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 19 / 241088 1 / 39531 15 / 207348 -- 19 / 241088 1 / 39531 15 / 207348 --
pooled tissue 96 / 276455   -- -- 96 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 6 / 79993 5 / 107080 19 / 266949 17 / 491794 6 / 79993 5 / 107080 19 / 266949 17 / 491794
retina 8 / 29438 -- 443 / 820326   8 / 29438 -- 443 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 2 / 73633 175 / 125377 11656 / 26905847 14978 / 34522313 2 / 73633 175 / 125377 11656 / 26905847 14978 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 18 / 52939   -- -- 18 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 3623 / 6230144 -- -- -- 3623 / 6230144 --
stomach   4 / 65644 7 / 124767 119 / 448716 0 / 26641 4 / 65644 7 / 124767 119 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 12 / 143630 2 / 100058 -- 1923 / 12372003 12 / 143630 2 / 100058 -- 1923 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606 12 / 115938 2 / 124664 0 / 11737 2 / 32606 12 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 5 / 207932 39 / 479819 8 / 21833 28 / 51729 5 / 207932 39 / 479819 8 / 21833 28 / 51729
uterus 4 / 38063 7 / 133582 1652 / 10193077 -- 4 / 38063 7 / 133582 1652 / 10193077 --
vascular 4 / 46250 -- 63 / 13135050 -- 4 / 46250 -- 63 / 13135050 --
white blood cells -- -- 840 / 846268 -- -- -- 840 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --