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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.654437Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 357 / 3316537 24 / 2498449 2208 / 114162531 1007 / 109592465 357 / 3316537 24 / 2498449 2208 / 114162531 1007 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     13 / 5047110 34 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 13 / 5047110 34 / 4978364
brain 1 / 506301   12 / 729526 93 / 4997811 1 / 506301 0 / 200215 12 / 729526 93 / 4997811
cartilage     -- 1 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 1 / 778035
cerebellum     9 / 90885 32 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 9 / 90885 32 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon       1 / 643586 0 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye       36 / 12434232 0 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 36 / 12434232
gastrointestinal tract     1 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart     1 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney         0 / 106627 0 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 7 / 96846   1 / 66308   7 / 96846 0 / 107249 1 / 66308 0 / 214987
lung     5 / 159917 10 / 159059 0 / 128150 0 / 170663 5 / 159917 10 / 159059
lymph node     147 / 5278419 11 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 147 / 5278419 11 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   1 / 104307 38 / 43166038 573 / 30312656 0 / 46553 1 / 104307 38 / 43166038 573 / 30312656
muscle 1 / 74039   2 / 107836 3 / 61270 1 / 74039 0 / 27691 2 / 107836 3 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary       21 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 21 / 179472
pancreas 80 / 7237 11 / 74930 86 / 85728 1 / 189999 80 / 7237 11 / 74930 86 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet 255 / 96524 12 / 30072 -- -- 255 / 96524 12 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 1 / 241088   1 / 207348 -- 1 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 5 / 276455   -- -- 5 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993   3 / 266949 1 / 491794 2 / 79993 0 / 107080 3 / 266949 1 / 491794
retina   -- 56 / 820326 2 / 88490 0 / 29438 -- 56 / 820326 2 / 88490
salivary gland 1 / 2490   -- -- 1 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 1 / 73633   429 / 26905847 160 / 34522313 1 / 73633 0 / 125377 429 / 26905847 160 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 1 / 6230144 -- -- -- 1 / 6230144 --
stomach     1 / 124767 4 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 1 / 124767 4 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 5 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 5 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     7 / 115938 19 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 7 / 115938 19 / 124664
uncharacterized tissue 3 / 207932       3 / 207932 0 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus     1344 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 1344 / 10193077 --
vascular   -- 36 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 36 / 13135050 --
white blood cells -- -- 15 / 846268 -- -- -- 15 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --