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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.654400Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 489 / 3316537 1180 / 2498449 7349 / 114162531 7189 / 109592465 489 / 3316537 1180 / 2498449 7349 / 114162531 7189 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 15 / 57865 -- 24 / 83577 2 / 16077 15 / 57865 -- 24 / 83577
bone marrow 2 / 14774 3 / 29891 896 / 5047110 763 / 4978364 2 / 14774 3 / 29891 896 / 5047110 763 / 4978364
brain 59 / 506301 127 / 200215 36 / 729526 472 / 4997811 59 / 506301 127 / 200215 36 / 729526 472 / 4997811
cartilage   9 / 37226 -- 162 / 778035 0 / 15965 9 / 37226 -- 162 / 778035
cerebellum     3 / 90885 166 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 3 / 90885 166 / 1495938
cerebrum 4 / 198932 1 / 3422 -- -- 4 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 32 / 44577 -- -- 1 / 3888 32 / 44577 -- --
colon 6 / 26551 58 / 151167 2 / 98089 111 / 643586 6 / 26551 58 / 151167 2 / 98089 111 / 643586
ear 4 / 16130 -- -- -- 4 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 82 / 246043   -- -- 82 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 51 / 128826 76 / 46440 9 / 85898 693 / 12434232 51 / 128826 76 / 46440 9 / 85898 693 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 5 / 12721 4 / 45908 -- 1 / 28803 5 / 12721 4 / 45908 --
heart 9 / 76442   2 / 83063 -- 9 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 3 / 106627 43 / 89898 8 / 155372 14 / 100281 3 / 106627 43 / 89898 8 / 155372 14 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 8 / 96846 23 / 107249 2 / 66308 18 / 214987 8 / 96846 23 / 107249 2 / 66308 18 / 214987
lung 15 / 128150 124 / 170663 11 / 159917 7 / 159059 15 / 128150 124 / 170663 11 / 159917 7 / 159059
lymph node 10 / 62650 14 / 27007 295 / 5278419 142 / 4863489 10 / 62650 14 / 27007 295 / 5278419 142 / 4863489
lymphoreticular 32 / 17836 56 / 44303 -- -- 32 / 17836 56 / 44303 -- --
mammary gland   41 / 104307 1588 / 43166038 1563 / 30312656 0 / 46553 41 / 104307 1588 / 43166038 1563 / 30312656
muscle 5 / 74039 31 / 27691 10 / 107836 9 / 61270 5 / 74039 31 / 27691 10 / 107836 9 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 72 / 89988 12 / 94887 23 / 179472 1 / 11462 72 / 89988 12 / 94887 23 / 179472
pancreas   29 / 74930 1 / 85728 13 / 189999 0 / 7237 29 / 74930 1 / 85728 13 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524   -- -- 4 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system 6 / 14891   -- -- 6 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 42 / 241088 78 / 39531 14 / 207348 -- 42 / 241088 78 / 39531 14 / 207348 --
pooled tissue 39 / 276455   -- -- 39 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 11 / 79993 37 / 107080 34 / 266949 86 / 491794 11 / 79993 37 / 107080 34 / 266949 86 / 491794
retina 1 / 29438 -- 17 / 820326 6 / 88490 1 / 29438 -- 17 / 820326 6 / 88490
salivary gland   10 / 10368 -- -- 0 / 2490 10 / 10368 -- --
skin 13 / 73633 101 / 125377 1197 / 26905847 869 / 34522313 13 / 73633 101 / 125377 1197 / 26905847 869 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 5 / 52939   -- -- 5 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 595 / 6230144 -- -- -- 595 / 6230144 --
stomach   8 / 65644 16 / 124767 89 / 448716 0 / 26641 8 / 65644 16 / 124767 89 / 448716
synovium   2 / 1650 -- -- 0 / 249 2 / 1650 -- --
testis 13 / 143630 8 / 100058 -- 1941 / 12372003 13 / 143630 8 / 100058 -- 1941 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   4 / 32606 15 / 115938 9 / 124664 0 / 11737 4 / 32606 15 / 115938 9 / 124664
uncharacterized tissue 47 / 207932 112 / 479819 1 / 21833 9 / 51729 47 / 207932 112 / 479819 1 / 21833 9 / 51729
uterus 7 / 38063 57 / 133582 2100 / 10193077 -- 7 / 38063 57 / 133582 2100 / 10193077 --
vascular   -- 458 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 458 / 13135050 --
white blood cells -- -- 23 / 846268 -- -- -- 23 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --