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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.6540Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 125 / 3316537 53 / 2498449 373 / 114162531 484 / 109592465 125 / 3316537 53 / 2498449 373 / 114162531 484 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow         0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 50 / 506301 5 / 200215 42 / 729526 52 / 4997811 50 / 506301 5 / 200215 42 / 729526 52 / 4997811
cartilage     -- 1 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 1 / 778035
cerebellum 1 / 90353     60 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 0 / 90885 60 / 1495938
cerebrum 28 / 198932   -- -- 28 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   1 / 151167     0 / 26551 1 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 20 / 246043   -- -- 20 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 3 / 128826     14 / 12434232 3 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 14 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 1 / 76442     -- 1 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 8 / 106627 4 / 89898     8 / 106627 4 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   1 / 107249     0 / 96846 1 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 2 / 128150 5 / 170663 1 / 159917 2 / 159059 2 / 128150 5 / 170663 1 / 159917 2 / 159059
lymph node     32 / 5278419   0 / 62650 0 / 27007 32 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 2 / 104307 143 / 43166038 171 / 30312656 1 / 46553 2 / 104307 143 / 43166038 171 / 30312656
muscle 1 / 74039 1 / 27691   1 / 61270 1 / 74039 1 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462     1 / 179472 1 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 1 / 179472
pancreas         0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524   -- -- 1 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 3 / 241088 1 / 39531 3 / 207348 -- 3 / 241088 1 / 39531 3 / 207348 --
pooled tissue 1 / 276455   -- -- 1 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   4 / 107080 1 / 266949 4 / 491794 0 / 79993 4 / 107080 1 / 266949 4 / 491794
retina   -- 16 / 820326   0 / 29438 -- 16 / 820326 0 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin   11 / 125377 17 / 26905847 121 / 34522313 0 / 73633 11 / 125377 17 / 26905847 121 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 87 / 6230144 -- -- -- 87 / 6230144 --
stomach       1 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630 2 / 100058 -- 56 / 12372003 1 / 143630 2 / 100058 -- 56 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 1 / 207932 13 / 479819     1 / 207932 13 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus     22 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 22 / 10193077 --
vascular   -- 7 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 7 / 13135050 --
white blood cells -- -- 2 / 846268 -- -- -- 2 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --