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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.652690Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 269 / 3316537 195 / 2498449 1261 / 114162531 2541 / 109592465 269 / 3316537 195 / 2498449 1261 / 114162531 2541 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 2 / 57865 --   1 / 16077 2 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774 1 / 29891 46 / 5047110 2 / 4978364 1 / 14774 1 / 29891 46 / 5047110 2 / 4978364
brain 47 / 506301 18 / 200215 103 / 729526 788 / 4997811 47 / 506301 18 / 200215 103 / 729526 788 / 4997811
cartilage   4 / 37226 -- 23 / 778035 0 / 15965 4 / 37226 -- 23 / 778035
cerebellum 1 / 90353   5 / 90885 121 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 5 / 90885 121 / 1495938
cerebrum 7 / 198932   -- -- 7 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 15 / 151167 5 / 98089 26 / 643586 2 / 26551 15 / 151167 5 / 98089 26 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 21 / 246043   -- -- 21 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 11 / 128826 4 / 46440 3 / 85898 5 / 12434232 11 / 128826 4 / 46440 3 / 85898 5 / 12434232
gastrointestinal tract   2 / 12721   -- 0 / 28803 2 / 12721 0 / 45908 --
heart 8 / 76442   3 / 83063 -- 8 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 1 / 106627 3 / 89898 6 / 155372 2 / 100281 1 / 106627 3 / 89898 6 / 155372 2 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 5 / 107249 12 / 66308 3 / 214987 3 / 96846 5 / 107249 12 / 66308 3 / 214987
lung 26 / 128150 14 / 170663 18 / 159917 6 / 159059 26 / 128150 14 / 170663 18 / 159917 6 / 159059
lymph node     103 / 5278419 21 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 103 / 5278419 21 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 5 / 46553 33 / 104307 135 / 43166038 1146 / 30312656 5 / 46553 33 / 104307 135 / 43166038 1146 / 30312656
muscle 9 / 74039   1 / 107836 1 / 61270 9 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 1 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   7 / 89988 4 / 94887 17 / 179472 0 / 11462 7 / 89988 4 / 94887 17 / 179472
pancreas   6 / 74930 1 / 85728 4 / 189999 0 / 7237 6 / 74930 1 / 85728 4 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524   -- -- 4 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 68 / 241088 2 / 39531 10 / 207348 -- 68 / 241088 2 / 39531 10 / 207348 --
pooled tissue 22 / 276455   -- -- 22 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 14 / 79993 11 / 107080 12 / 266949 11 / 491794 14 / 79993 11 / 107080 12 / 266949 11 / 491794
retina 2 / 29438 -- 46 / 820326   2 / 29438 -- 46 / 820326 0 / 88490
salivary gland   9 / 10368 -- -- 0 / 2490 9 / 10368 -- --
skin 5 / 73633   235 / 26905847 158 / 34522313 5 / 73633 0 / 125377 235 / 26905847 158 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 78 / 6230144 -- -- -- 78 / 6230144 --
stomach   7 / 65644 8 / 124767 36 / 448716 0 / 26641 7 / 65644 8 / 124767 36 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 3 / 143630 6 / 100058 -- 141 / 12372003 3 / 143630 6 / 100058 -- 141 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606 32 / 115938 26 / 124664 0 / 11737 2 / 32606 32 / 115938 26 / 124664
uncharacterized tissue 5 / 207932 21 / 479819 3 / 21833 4 / 51729 5 / 207932 21 / 479819 3 / 21833 4 / 51729
uterus 1 / 38063 20 / 133582 314 / 10193077 -- 1 / 38063 20 / 133582 314 / 10193077 --
vascular   -- 34 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 34 / 13135050 --
white blood cells -- -- 44 / 846268 -- -- -- 44 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --