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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.65234Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 233 / 3316537 338 / 2498449 2895 / 114162531 3050 / 109592465 233 / 3316537 338 / 2498449 2895 / 114162531 3050 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 3 / 57865 --   2 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   4 / 29891 184 / 5047110 188 / 4978364 0 / 14774 4 / 29891 184 / 5047110 188 / 4978364
brain 28 / 506301 33 / 200215 14 / 729526 117 / 4997811 28 / 506301 33 / 200215 14 / 729526 117 / 4997811
cartilage   2 / 37226 -- 15 / 778035 0 / 15965 2 / 37226 -- 15 / 778035
cerebellum 5 / 90353   4 / 90885 41 / 1495938 5 / 90353 0 / 0 4 / 90885 41 / 1495938
cerebrum 16 / 198932 7 / 3422 -- -- 16 / 198932 7 / 3422 -- --
cervix   3 / 44577 -- -- 0 / 3888 3 / 44577 -- --
colon   17 / 151167   17 / 643586 0 / 26551 17 / 151167 0 / 98089 17 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 18 / 246043   -- -- 18 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564 1 / 2857 -- -- 1 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   7 / 17290 -- -- 0 / 270 7 / 17290 -- --
eye 9 / 128826 2 / 46440 2 / 85898 285 / 12434232 9 / 128826 2 / 46440 2 / 85898 285 / 12434232
gastrointestinal tract 8 / 28803 2 / 12721 3 / 45908 -- 8 / 28803 2 / 12721 3 / 45908 --
heart 4 / 76442     -- 4 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 15 / 106627 5 / 89898 5 / 155372 1 / 100281 15 / 106627 5 / 89898 5 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 7 / 96846 25 / 107249 1 / 66308 3 / 214987 7 / 96846 25 / 107249 1 / 66308 3 / 214987
lung 8 / 128150 18 / 170663 2 / 159917 4 / 159059 8 / 128150 18 / 170663 2 / 159917 4 / 159059
lymph node   2 / 27007 104 / 5278419 29 / 4863489 0 / 62650 2 / 27007 104 / 5278419 29 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 15 / 44303 -- -- 1 / 17836 15 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 30 / 104307 1351 / 43166038 762 / 30312656 1 / 46553 30 / 104307 1351 / 43166038 762 / 30312656
muscle 15 / 74039 5 / 27691   3 / 61270 15 / 74039 5 / 27691 0 / 107836 3 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 4 / 89988 4 / 94887 10 / 179472 1 / 11462 4 / 89988 4 / 94887 10 / 179472
pancreas   4 / 74930 1 / 85728 5 / 189999 0 / 7237 4 / 74930 1 / 85728 5 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524 1 / 30072 -- -- 4 / 96524 1 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 15 / 241088 9 / 39531 4 / 207348 -- 15 / 241088 9 / 39531 4 / 207348 --
pooled tissue 7 / 276455   -- -- 7 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 3 / 79993 1 / 107080 3 / 266949 10 / 491794 3 / 79993 1 / 107080 3 / 266949 10 / 491794
retina 1 / 29438 -- 10 / 820326 3 / 88490 1 / 29438 -- 10 / 820326 3 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 7 / 73633 31 / 125377 583 / 26905847 1030 / 34522313 7 / 73633 31 / 125377 583 / 26905847 1030 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 9 / 52939   -- -- 9 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 121 / 6230144 -- -- -- 121 / 6230144 --
stomach 3 / 26641 11 / 65644 1 / 124767 23 / 448716 3 / 26641 11 / 65644 1 / 124767 23 / 448716
synovium   2 / 1650 -- -- 0 / 249 2 / 1650 -- --
testis 14 / 143630 9 / 100058 -- 498 / 12372003 14 / 143630 9 / 100058 -- 498 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737   3 / 115938 5 / 124664 1 / 11737 0 / 32606 3 / 115938 5 / 124664
uncharacterized tissue 22 / 207932 70 / 479819 1 / 21833 1 / 51729 22 / 207932 70 / 479819 1 / 21833 1 / 51729
uterus   12 / 133582 312 / 10193077 -- 0 / 38063 12 / 133582 312 / 10193077 --
vascular 6 / 46250 -- 165 / 13135050 -- 6 / 46250 -- 165 / 13135050 --
white blood cells -- -- 17 / 846268 -- -- -- 17 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --