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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.645274Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 52 / 3316537 28 / 2498449 763 / 114162531 1071 / 109592465 52 / 3316537 28 / 2498449 763 / 114162531 1071 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     3 / 5047110   0 / 14774 0 / 29891 3 / 5047110 0 / 4978364
brain 14 / 506301   9 / 729526 29 / 4997811 14 / 506301 0 / 200215 9 / 729526 29 / 4997811
cartilage     --   0 / 15965 0 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum 2 / 90353     12 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 0 / 90885 12 / 1495938
cerebrum 5 / 198932   -- -- 5 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon   1 / 151167   2 / 643586 0 / 26551 1 / 151167 0 / 98089 2 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 3 / 246043   -- -- 3 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 4 / 128826     137 / 12434232 4 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 137 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart     3 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 3 / 106627 2 / 89898 1 / 155372   3 / 106627 2 / 89898 1 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 1 / 107249   3 / 214987 1 / 96846 1 / 107249 0 / 66308 3 / 214987
lung         0 / 128150 0 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node     22 / 5278419 148 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 22 / 5278419 148 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 1 / 104307 11 / 43166038 61 / 30312656 2 / 46553 1 / 104307 11 / 43166038 61 / 30312656
muscle 2 / 74039     3 / 61270 2 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 3 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary         0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas         0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 9 / 96524   -- -- 9 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta     1 / 207348 -- 0 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 2 / 276455   -- -- 2 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   1 / 107080 4 / 266949 5 / 491794 0 / 79993 1 / 107080 4 / 266949 5 / 491794
retina   -- 5 / 820326   0 / 29438 -- 5 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     314 / 26905847 423 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 314 / 26905847 423 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 82 / 6230144 -- -- -- 82 / 6230144 --
stomach       3 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 3 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 4 / 143630 3 / 100058 -- 241 / 12372003 4 / 143630 3 / 100058 -- 241 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     1 / 115938 2 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue   14 / 479819   2 / 51729 0 / 207932 14 / 479819 0 / 21833 2 / 51729
uterus   3 / 133582 163 / 10193077 -- 0 / 38063 3 / 133582 163 / 10193077 --
vascular   -- 141 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 141 / 13135050 --
white blood cells -- -- 3 / 846268 -- -- -- 3 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --