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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.644231Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 336 / 3316537 279 / 2498449 2568 / 114162531 3426 / 109592465 336 / 3316537 279 / 2498449 2568 / 114162531 3426 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 2 / 57865 --   2 / 16077 2 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774 5 / 29891 226 / 5047110 31 / 4978364 1 / 14774 5 / 29891 226 / 5047110 31 / 4978364
brain 52 / 506301 14 / 200215 16 / 729526 102 / 4997811 52 / 506301 14 / 200215 16 / 729526 102 / 4997811
cartilage 3 / 15965 11 / 37226 -- 5 / 778035 3 / 15965 11 / 37226 -- 5 / 778035
cerebellum 7 / 90353   1 / 90885 18 / 1495938 7 / 90353 0 / 0 1 / 90885 18 / 1495938
cerebrum 22 / 198932   -- -- 22 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   8 / 44577 -- -- 0 / 3888 8 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 40 / 151167 1 / 98089 13 / 643586 2 / 26551 40 / 151167 1 / 98089 13 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 14 / 246043   -- -- 14 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   4 / 17290 -- -- 0 / 270 4 / 17290 -- --
eye 11 / 128826   1 / 85898 49 / 12434232 11 / 128826 0 / 46440 1 / 85898 49 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803     -- 3 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 9 / 76442   4 / 83063 -- 9 / 76442 0 / 1 4 / 83063 --
kidney 2 / 106627 6 / 89898 8 / 155372   2 / 106627 6 / 89898 8 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 28 / 96846 8 / 107249 3 / 66308 25 / 214987 28 / 96846 8 / 107249 3 / 66308 25 / 214987
lung 19 / 128150 30 / 170663 24 / 159917 7 / 159059 19 / 128150 30 / 170663 24 / 159917 7 / 159059
lymph node 1 / 62650 8 / 27007 179 / 5278419 23 / 4863489 1 / 62650 8 / 27007 179 / 5278419 23 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 4 / 104307 495 / 43166038 1673 / 30312656 1 / 46553 4 / 104307 495 / 43166038 1673 / 30312656
muscle 1 / 74039   2 / 107836   1 / 74039 0 / 27691 2 / 107836 0 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 7 / 89988   1 / 179472 2 / 11462 7 / 89988 0 / 94887 1 / 179472
pancreas   30 / 74930     0 / 7237 30 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 20 / 96524   -- -- 20 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 30 / 241088 3 / 39531 5 / 207348 -- 30 / 241088 3 / 39531 5 / 207348 --
pooled tissue 28 / 276455   -- -- 28 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 9 / 79993 2 / 107080 7 / 266949 5 / 491794 9 / 79993 2 / 107080 7 / 266949 5 / 491794
retina   -- 3 / 820326 3 / 88490 0 / 29438 -- 3 / 820326 3 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin 9 / 73633   898 / 26905847 1234 / 34522313 9 / 73633 0 / 125377 898 / 26905847 1234 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 60 / 6230144 -- -- -- 60 / 6230144 --
stomach 4 / 26641 17 / 65644 3 / 124767 12 / 448716 4 / 26641 17 / 65644 3 / 124767 12 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630 3 / 100058 -- 218 / 12372003 2 / 143630 3 / 100058 -- 218 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 12 / 115938 6 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 12 / 115938 6 / 124664
uncharacterized tissue 26 / 207932 59 / 479819   1 / 51729 26 / 207932 59 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 5 / 38063 14 / 133582 383 / 10193077 -- 5 / 38063 14 / 133582 383 / 10193077 --
vascular 6 / 46250 -- 209 / 13135050 -- 6 / 46250 -- 209 / 13135050 --
white blood cells -- -- 28 / 846268 -- -- -- 28 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --