Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.644108Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 473 / 3316537 211 / 2498449 1866 / 114162531 2058 / 109592465 473 / 3316537 211 / 2498449 1866 / 114162531 2058 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077   --   1 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     4 / 5047110 15 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 4 / 5047110 15 / 4978364
brain 5 / 506301   4 / 729526 35 / 4997811 5 / 506301 0 / 200215 4 / 729526 35 / 4997811
cartilage   3 / 37226 --   0 / 15965 3 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum       11 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 11 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   1 / 151167   7 / 643586 0 / 26551 1 / 151167 0 / 98089 7 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 50 / 246043   -- -- 50 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 7 / 128826   4 / 85898 11 / 12434232 7 / 128826 0 / 46440 4 / 85898 11 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 21 / 76442   3 / 83063 -- 21 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 27 / 106627 5 / 89898 3 / 155372   27 / 106627 5 / 89898 3 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 13 / 96846 100 / 107249   2 / 214987 13 / 96846 100 / 107249 0 / 66308 2 / 214987
lung 35 / 128150 2 / 170663 12 / 159917 2 / 159059 35 / 128150 2 / 170663 12 / 159917 2 / 159059
lymph node     9 / 5278419 3 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 9 / 5278419 3 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 16 / 104307 130 / 43166038 907 / 30312656 1 / 46553 16 / 104307 130 / 43166038 907 / 30312656
muscle 5 / 74039     4 / 61270 5 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 4 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 9 / 89988   2 / 179472 1 / 11462 9 / 89988 0 / 94887 2 / 179472
pancreas   1 / 74930     0 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524   -- -- 2 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 214 / 241088   380 / 207348 -- 214 / 241088 0 / 39531 380 / 207348 --
pooled tissue 51 / 276455   -- -- 51 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993     4 / 491794 1 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 4 / 491794
retina 1 / 29438 -- 13 / 820326   1 / 29438 -- 13 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 5 / 73633   610 / 26905847 315 / 34522313 5 / 73633 0 / 125377 610 / 26905847 315 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 353 / 6230144 -- -- -- 353 / 6230144 --
stomach       10 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 10 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630 27 / 100058 -- 701 / 12372003 1 / 143630 27 / 100058 -- 701 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606 10 / 115938   0 / 11737 2 / 32606 10 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 18 / 207932 45 / 479819   29 / 51729 18 / 207932 45 / 479819 0 / 21833 29 / 51729
uterus 5 / 38063   318 / 10193077 -- 5 / 38063 0 / 133582 318 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 12 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 12 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1 / 846268 -- -- -- 1 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --