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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.644077Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 115 / 3316537 56 / 2498449 669 / 114162531 1127 / 109592465 115 / 3316537 56 / 2498449 669 / 114162531 1127 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   1 / 29891 38 / 5047110 23 / 4978364 0 / 14774 1 / 29891 38 / 5047110 23 / 4978364
brain 22 / 506301 4 / 200215 7 / 729526 69 / 4997811 22 / 506301 4 / 200215 7 / 729526 69 / 4997811
cartilage     -- 6 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 6 / 778035
cerebellum 2 / 90353   1 / 90885 55 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 1 / 90885 55 / 1495938
cerebrum 15 / 198932 1 / 3422 -- -- 15 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 3 / 151167   1 / 643586 1 / 26551 3 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 4 / 246043   -- -- 4 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 3 / 128826   4 / 85898 168 / 12434232 3 / 128826 0 / 46440 4 / 85898 168 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803     -- 2 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart     2 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 5 / 106627 4 / 89898     5 / 106627 4 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 7 / 107249     3 / 96846 7 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 3 / 128150   2 / 159917 1 / 159059 3 / 128150 0 / 170663 2 / 159917 1 / 159059
lymph node 3 / 62650 2 / 27007 41 / 5278419 79 / 4863489 3 / 62650 2 / 27007 41 / 5278419 79 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 1 / 44303 -- -- 1 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland   4 / 104307 91 / 43166038 401 / 30312656 0 / 46553 4 / 104307 91 / 43166038 401 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary       3 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 3 / 179472
pancreas     1 / 85728 2 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 1 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524 2 / 30072 -- -- 1 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 17 / 241088   4 / 207348 -- 17 / 241088 0 / 39531 4 / 207348 --
pooled tissue 10 / 276455   -- -- 10 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993 2 / 107080 2 / 266949 3 / 491794 1 / 79993 2 / 107080 2 / 266949 3 / 491794
retina 7 / 29438 -- 8 / 820326 2 / 88490 7 / 29438 -- 8 / 820326 2 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 1 / 73633 1 / 125377 140 / 26905847 193 / 34522313 1 / 73633 1 / 125377 140 / 26905847 193 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 56 / 6230144 -- -- -- 56 / 6230144 --
stomach       5 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 5 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 5 / 143630 6 / 100058 -- 115 / 12372003 5 / 143630 6 / 100058 -- 115 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 2 / 32606 2 / 115938   1 / 11737 2 / 32606 2 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 6 / 207932 11 / 479819 1 / 21833 1 / 51729 6 / 207932 11 / 479819 1 / 21833 1 / 51729
uterus   1 / 133582 203 / 10193077 -- 0 / 38063 1 / 133582 203 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 63 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 63 / 13135050 --
white blood cells -- -- 3 / 846268 -- -- -- 3 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --