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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.643813Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 833 / 3316537 447 / 2498449 43010 / 114162531 33932 / 109592465 833 / 3316537 447 / 2498449 43010 / 114162531 33932 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 12 / 16077 7 / 57865 -- 1 / 83577 12 / 16077 7 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow 5 / 14774 4 / 29891 80 / 5047110 36 / 4978364 5 / 14774 4 / 29891 80 / 5047110 36 / 4978364
brain 97 / 506301 13 / 200215 60 / 729526 480 / 4997811 97 / 506301 13 / 200215 60 / 729526 480 / 4997811
cartilage 11 / 15965 4 / 37226 -- 406 / 778035 11 / 15965 4 / 37226 -- 406 / 778035
cerebellum 4 / 90353   1 / 90885 81 / 1495938 4 / 90353 0 / 0 1 / 90885 81 / 1495938
cerebrum 15 / 198932   -- -- 15 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   4 / 44577 -- -- 0 / 3888 4 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 38 / 151167 1 / 98089 58 / 643586 3 / 26551 38 / 151167 1 / 98089 58 / 643586
ear 7 / 16130 -- -- -- 7 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 152 / 246043   -- -- 152 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564 1 / 2857 -- -- 1 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 15 / 128826 2 / 46440 8 / 85898 4380 / 12434232 15 / 128826 2 / 46440 8 / 85898 4380 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803 4 / 12721 1 / 45908 -- 3 / 28803 4 / 12721 1 / 45908 --
heart 18 / 76442   26 / 83063 -- 18 / 76442 0 / 1 26 / 83063 --
kidney 32 / 106627 10 / 89898 19 / 155372   32 / 106627 10 / 89898 19 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 20 / 96846 17 / 107249 9 / 66308 25 / 214987 20 / 96846 17 / 107249 9 / 66308 25 / 214987
lung 48 / 128150 12 / 170663 34 / 159917 7 / 159059 48 / 128150 12 / 170663 34 / 159917 7 / 159059
lymph node 4 / 62650 2 / 27007 959 / 5278419 93 / 4863489 4 / 62650 2 / 27007 959 / 5278419 93 / 4863489
lymphoreticular   3 / 44303 -- -- 0 / 17836 3 / 44303 -- --
mammary gland 11 / 46553 18 / 104307 14205 / 43166038 16600 / 30312656 11 / 46553 18 / 104307 14205 / 43166038 16600 / 30312656
muscle 81 / 74039   5 / 107836 7 / 61270 81 / 74039 0 / 27691 5 / 107836 7 / 61270
nervous 6 / 10333   -- -- 6 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 8 / 89988 34 / 94887 40 / 179472 2 / 11462 8 / 89988 34 / 94887 40 / 179472
pancreas   26 / 74930 6 / 85728 23 / 189999 0 / 7237 26 / 74930 6 / 85728 23 / 189999
pancreatic islet 25 / 96524 2 / 30072 -- -- 25 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid   6 / 20557 -- -- 0 / 24 6 / 20557 -- --
peripheral nervous system 5 / 14891   -- -- 5 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 65 / 241088 4 / 39531 20 / 207348 -- 65 / 241088 4 / 39531 20 / 207348 --
pooled tissue 16 / 276455   -- -- 16 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 7 / 79993 23 / 107080 77 / 266949 41 / 491794 7 / 79993 23 / 107080 77 / 266949 41 / 491794
retina   -- 6 / 820326 8 / 88490 0 / 29438 -- 6 / 820326 8 / 88490
salivary gland 1 / 2490   -- -- 1 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 30 / 73633 15 / 125377 4376 / 26905847 9051 / 34522313 30 / 73633 15 / 125377 4376 / 26905847 9051 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 7 / 52939   -- -- 7 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 1522 / 6230144 -- -- -- 1522 / 6230144 --
stomach   16 / 65644 7 / 124767 88 / 448716 0 / 26641 16 / 65644 7 / 124767 88 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 16 / 143630 39 / 100058 -- 2483 / 12372003 16 / 143630 39 / 100058 -- 2483 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   5 / 32606 15 / 115938 14 / 124664 0 / 11737 5 / 32606 15 / 115938 14 / 124664
uncharacterized tissue 46 / 207932 141 / 479819 9 / 21833 10 / 51729 46 / 207932 141 / 479819 9 / 21833 10 / 51729
uterus 16 / 38063 20 / 133582 1415 / 10193077 -- 16 / 38063 20 / 133582 1415 / 10193077 --
vascular 50 / 46250 -- 19989 / 13135050 -- 50 / 46250 -- 19989 / 13135050 --
white blood cells -- -- 126 / 846268 -- -- -- 126 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --