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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.642938Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 804 / 3316537 29 / 2498449 674 / 114162531 1011 / 109592465 804 / 3316537 29 / 2498449 674 / 114162531 1011 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     11 / 5047110   0 / 14774 0 / 29891 11 / 5047110 0 / 4978364
brain 4 / 506301 1 / 200215 10 / 729526 38 / 4997811 4 / 506301 1 / 200215 10 / 729526 38 / 4997811
cartilage     --   0 / 15965 0 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum       15 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 15 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon     2 / 98089   0 / 26551 0 / 151167 2 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 1 / 246043   -- -- 1 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye       82 / 12434232 0 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 82 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart     1 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney     1 / 155372   0 / 106627 0 / 89898 1 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 42 / 96846 19 / 107249 1 / 66308 2 / 214987 42 / 96846 19 / 107249 1 / 66308 2 / 214987
lung   2 / 170663 2 / 159917   0 / 128150 2 / 170663 2 / 159917 0 / 159059
lymph node     48 / 5278419 71 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 48 / 5278419 71 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     15 / 43166038 181 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 15 / 43166038 181 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     2 / 94887 1 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 2 / 94887 1 / 179472
pancreas   1 / 74930     0 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 671 / 241088     -- 671 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 27 / 276455   -- -- 27 / 276455 0 / 0 -- --
prostate     1 / 266949 3 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 1 / 266949 3 / 491794
retina   -- 9 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 9 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 1 / 73633   342 / 26905847 237 / 34522313 1 / 73633 0 / 125377 342 / 26905847 237 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 46 / 6230144 -- -- -- 46 / 6230144 --
stomach     1 / 124767 1 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 1 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 377 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 377 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     3 / 115938 2 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 3 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue   5 / 479819     0 / 207932 5 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 56 / 38063   64 / 10193077 -- 56 / 38063 0 / 133582 64 / 10193077 --
vascular   -- 113 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 113 / 13135050 --
white blood cells -- -- 2 / 846268 -- -- -- 2 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --