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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.642842Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 139 / 3316537 72 / 2498449 987 / 114162531 1423 / 109592465 139 / 3316537 72 / 2498449 987 / 114162531 1423 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 -- 1 / 83577 0 / 16077 3 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow 2 / 14774 1 / 29891 5 / 5047110 5 / 4978364 2 / 14774 1 / 29891 5 / 5047110 5 / 4978364
brain 17 / 506301 4 / 200215 6 / 729526 50 / 4997811 17 / 506301 4 / 200215 6 / 729526 50 / 4997811
cartilage 3 / 15965 1 / 37226 -- 10 / 778035 3 / 15965 1 / 37226 -- 10 / 778035
cerebellum       17 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 17 / 1495938
cerebrum 5 / 198932   -- -- 5 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   3 / 44577 -- -- 0 / 3888 3 / 44577 -- --
colon   2 / 151167   1 / 643586 0 / 26551 2 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 22 / 246043   -- -- 22 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 2 / 128826 1 / 46440   105 / 12434232 2 / 128826 1 / 46440 0 / 85898 105 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 3 / 76442   1 / 83063 -- 3 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 7 / 106627 7 / 89898     7 / 106627 7 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 4 / 96846 2 / 107249 1 / 66308 3 / 214987 4 / 96846 2 / 107249 1 / 66308 3 / 214987
lung 3 / 128150 4 / 170663 2 / 159917   3 / 128150 4 / 170663 2 / 159917 0 / 159059
lymph node 2 / 62650   15 / 5278419 22 / 4863489 2 / 62650 0 / 27007 15 / 5278419 22 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 4 / 46553 2 / 104307 234 / 43166038 773 / 30312656 4 / 46553 2 / 104307 234 / 43166038 773 / 30312656
muscle 1 / 74039 2 / 27691     1 / 74039 2 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 1 / 89988   2 / 179472 1 / 11462 1 / 89988 0 / 94887 2 / 179472
pancreas   1 / 74930 1 / 85728   0 / 7237 1 / 74930 1 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 16 / 241088 1 / 39531 2 / 207348 -- 16 / 241088 1 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 18 / 276455   -- -- 18 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   1 / 107080 1 / 266949 1 / 491794 0 / 79993 1 / 107080 1 / 266949 1 / 491794
retina   -- 6 / 820326 2 / 88490 0 / 29438 -- 6 / 820326 2 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 7 / 73633 2 / 125377 295 / 26905847 212 / 34522313 7 / 73633 2 / 125377 295 / 26905847 212 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 66 / 6230144 -- -- -- 66 / 6230144 --
stomach   5 / 65644 2 / 124767 9 / 448716 0 / 26641 5 / 65644 2 / 124767 9 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 7 / 143630 7 / 100058 -- 207 / 12372003 7 / 143630 7 / 100058 -- 207 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606   2 / 124664 0 / 11737 2 / 32606 0 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 2 / 207932 14 / 479819   1 / 51729 2 / 207932 14 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 1 / 38063 4 / 133582 230 / 10193077 -- 1 / 38063 4 / 133582 230 / 10193077 --
vascular 6 / 46250 -- 117 / 13135050 -- 6 / 46250 -- 117 / 13135050 --
white blood cells -- -- 3 / 846268 -- -- -- 3 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --